Doktorandplats inom RNA diagnostik

Vill du bidra till medicinsk forskning av toppkvalitet?

Att vara doktorand innebär att vara antagen till en utbildning på forskarnivå (forskarutbildning) där man följer en individuell studieplan. En doktorand ägnar sig åt ett forskningsprojekt under handledning, kompletterat med kurser och andra lärandeaktiviteter. För en doktorsexamen krävs motsvarande fyra års utbildning på forskarnivå på heltid.

Forskargruppen

En doktorandplats är tillgänglig i Rickard Sandbergs laboratorium vid Institutionen för Cell- och Molekylärbiologi (CMB). Laboratoriet är beläget i Biomedicum, en forskningsbyggnad i världsklass med modern infrastruktur och utrustning. Rickards laboratorium har fokuserat på att utveckla genomiska teknologier för att studera transkriptionsreglering i enskilda celler. Laboratoriet representeras lika mycket av experimentella och beräkningsinriktade forskare, och vi genomför alla aspekter av projekten inom laboratoriet samt i samarbeten. Vi har utvecklat ett unikt automatiserat robotiserat laboratorium för högkapacitets full-längds scRNA-seq för att generera splitsning-informativ enkelcells-RNA-sekvenseringsdata över komplexa vävnader.
Dessutom anpassas den RNA-sekvensbaserade tekniken som utvecklats i laboratoriet alltmer för diagnostiska applikationer, inklusive tidig upptäckt av sjukdom.

Gene regulation, genome-wide experimental and computational techniques – Rickard Sandberg's Group | Karolinska Institutet

Doktorandprojektet och doktorandens uppgifter

Doktoranden kommer att leda ett projekt som fokuserar på att förbättra beräkningsanalyser av RNA-mätningar från mänskliga prover, t.ex. blod, för att systematiskt utvärdera RNA:s diagnostiska potential. Doktoranden kommer att ha tillgång till internt genererade data som ska analyseras i jämförelse med externa data som kommer att laddas ner och utforskas på ett omfattande sätt. Projektet omfattar även att utveckla eller tillämpa maskininlärningsmetoder för att identifiera de mest prediktiva RNA-signaturerna och använda automatiserade strategier för att härleda celltyp av ursprung och/eller celltillstånd.

Den framgångsrika kandidaten kommer att ansvara för hantering och bearbetning av stora datamängder på dedikerade servrar samt för utveckling av de datorprogram som krävs. Ett stort fokus kommer att ligga på utforskande dataanalyser och maskininlärning.

Vad erbjuder vi? 

En kreativ, internationell och inspirerande miljö fylld av kompetens och nyfikenhet. Karolinska Institutet är ett av världens ledande medicinska universitet. Här bedriver vi framgångsrik medicinsk forskning och har det största utbudet av medicinska utbildningar i Sverige. På KI får du träffa forskare med olika forskningsinriktningar som jobbar tillsammans. Det är det gränsöverskridande samarbetet som bidrar till KI:s världsledande position inom forskning. Som doktorand erbjuds du ett individuellt forskningsprojekt, en välutbildad handledare, ett stort utbud av valbara kurser och möjligheten att arbeta i en framgångsrik forskargrupp. Karolinska Institutet har samarbeten med framstående universitet över hela världen, vilket ger möjlighet till internationella utbyten. Som anställd doktorand får du en avtalsenlig lön, du får träna fritt i våra moderna friskvårdsanläggningar och du får ersättning för läkarvård.

Behörighetskrav för utbildning på forskarnivå

För att delta i urvalet till en doktorandplats måste du styrka både det grundläggande (A) och det särskilda (B) behörighetskravet innan ansökningsperioden stänger.

Det är ditt ansvar som sökande att styrka din behörighet genom att följa instruktionerna på webbsidan Behörighet till utbildning på forskarnivå.

A) Grundläggande behörighetskrav

Du uppfyller det grundläggande behörighetskravet för utbildning på forskarnivå om du:

1. har avlagt en examen på avancerad nivå (magister- eller masterexamen), eller
2. har fullgjort kursfordringar om minst 240 högskolepoäng, varav minst 60 högskolepoäng på avancerad nivå, eller
3. har på annat sätt förvärvat i huvudsak motsvarande kunskaper.*

Följ instruktionerna på webbsidan Behörighet till utbildning på forskarnivå.

*Om du anser dig ha motsvarande kunskaper ska du följa instruktionerna på webbsidan Bedömning av motsvarande kunskaper för grundläggande behörighet till utbildning på forskarnivå.

B) Särskilt behörighetskrav

Du uppfyller det särskilda behörighetskravet för utbildning på forskarnivå om du:

- Intygar kunskaper i engelska (motsvarande Engelska B/Engelska 6 vid gymnasiet med godkänt betyg).

Följ instruktionerna på webbsidan English language requirements for doctoral education.

Kontroll av dokument

Karolinska Institutet gör kontroll av dokumenten för att upptäcka förfalskningar. Karolinska Institutet förbehåller sig rätten att återkalla antagningsbeslut om förfalskningar eller oriktigheter påvisas. Inlämnande av falska handlingar är ett brott mot svensk lag och anses vara grund för rättsliga åtgärder.

Färdigheter och personliga egenskaper

För att kvalificera sig till doktorandplatsen måste den sökande uppfylla följande krav:

• Masterexamen i biomedicin, molekylärbiologi, teknik, datavetenskap (eller liknande)
• Flytande engelska
• Utmärkta personliga- och kommunikationsförmågor

Vidare är kompetens inom följande områden meriterande:

• Datorkunskaper med Python, Git och andra programmeringsspråk
• Erfarenhet av molekylärbiologi.

Villkor

Doktorandplatsen innebär en anställning som doktorand under maximalt 4 år på heltid.

[Video om Karolinska Institutet, hur vi alla bidrar till en bättre hälsa för alla]

Ansökan

Du söker doktorandplatsen i rekryteringsverktyget Varbi. Använd knappen uppe till höger och följ anvisningarna. Vi ser gärna att din ansökan är skriven på engelska, men det går också bra att ansöka på svenska.

Din ansökan ska innehålla dessa dokument:

- Ett personligt brev och curriculum vitae 
- Eventuella examensarbeten och publikationer 
- Andra dokument som styrker de ovan efterfrågade färdigheter och egenskaper 
- Dokument som styrker det grundläggande behörighetskravet (se A ovan)
- Dokument som styrker det särskilda behörighetskravet (se B ovan)

Urval

Urval bland behöriga sökande görs med hänsyn till deras förmåga att tillgodogöra sig forskarutbildning. En samlad bedömning av de sökandes meriter och lämplighet kommer att göras.

Följande bedömningsgrunder tillämpas vid Karolinska Institutet:

- Dokumenterade ämneskunskaper av betydelse för forskningsområdet
- Analytisk skicklighet
- Övriga dokumenterade kunskaper/erfarenheter som kan ha betydelse för aktuell forskarutbildning  

Alla sökanden kommer att få information när rekryteringen är slutförd.

Vill du göra skillnad - och bidra till en bättre hälsa för alla? Sök till Karolinska Institutet