Två doktorander inom maskininlärning för radiologisk precisionsmedicin

Vill du bidra till medicinsk forskning av toppkvalitet?

Att vara doktorand innebär att vara antagen till en utbildning på forskarnivå (forskarutbildning) där man följer en individuell studieplan. En doktorand ägnar sig åt ett forskningsprojekt under handledning, kompletterat med kurser och andra lärandeaktiviteter. För en doktorsexamen krävs motsvarande fyra års utbildning på forskarnivå på heltid.

Forskargruppen

Forskargruppen leds av Fredrik Strand, MSc MD PhD, som har en blandad bakgrund inom medicin, teknik och ekonomi, och är bröstradiolog vid Karolinska Universitetssjukhuset. Biträdande handledare är Apostolia Tsirikoglou, MSc PhD, som är gruppens tekniska ledare. Totalt finns det cirka tio heltidsanställda: forskningsspecialist, postdoktor, doktorander och forskningsingenjörer. Vår forskning är internationellt erkänd för utveckling och utvärdering av AI för radiologisk bröstcancerdiagnostik med nyliga publikationer i Lancet Digital Health, JAMA Oncology, Radiology, MICCAI med flera. Gruppen har expertis inom radiologi, biostatistik och maskininlärning. Vi har ett starkt samarbete med forskargrupper vid KTH, KI och internationellt inom två EU-projekt samt ett nytt samarbete med en grupp vid Center for Computational Precision Health vid University of California Berkeley och San Francisco.

Doktorandprojektet och doktorandens uppgifter

Spår 1: AI-baserade bildriskmodeller för att förutsäga och individualisera övervakning för individer med genetisk risk för bröstcancer

Detta doktorandprojekt fokuserar på tidig identifiering och individualiserad övervakning av kvinnor med ärftlig eller polygen risk för bröstcancer, genom att integrera AI-härledda bildsignaturer från mammografi och MR med genetisk information.
Arbetet omfattar utveckling och träning av AI-modeller för riskprediktion, kvantitativ riskmodellering och kalibrering samt utvärdering av riskanpassade övervakningsstrategier med stark klinisk förankring och translational relevans.
Doktorandens uppgifter kommer att fokusera på träning och utvärdering av AI-modeller med mammografi och bröst-MR, kvantitativ riskmodellering och kalibrering samt integration av bildbaserad AI-risk med genetiska riskmått för att stödja individualiserade övervakningsstrategier.

Spår 2: Jämlikhet och skillnader i AI-stödd mammografiscreening

Detta doktorandprojekt undersöker rättvisa, jämlikhet och generaliserbarhet hos AI-system som används för bröstcancerdetektion och riskprediktion i populationsbaserad screening. Tjänsten finansieras av Vetenskapsrådet.
Projektet kombinerar populationsbaserad prestandautvärdering över etniska och socioekonomiska undergrupper med möjligheter till maskininlärningsjustering eller utveckling av rättvise-medvetna modeller när doktoranden har relevant teknisk bakgrund. Målet är både att identifiera skillnader och, där det är metodologiskt motiverat, utvärdera strategier för att minska dem samtidigt som den kliniska prestandan bibehålls.
Doktorandens uppgifter kommer att fokusera på utvärdering av AI-prestanda och jämlikhet över populationsundergrupper med hjälp av registerkopplade data, med valfri medverkan i omträning eller finjustering av modeller för att minska identifierade skillnader, beroende på doktorandens bakgrund.

Allmänna uppgifter för båda spåren

För båda spåren förväntas doktoranden bidra till studiedesign, statistisk analys, tolkning av resultat, vetenskapligt skrivande och spridning av resultat vid internationella konferenser. Dessutom ska doktoranden genomföra obligatoriska kurser och andra aktiviteter som ingår i ett doktorandprogram.

Vad erbjuder vi? 

En kreativ, internationell och inspirerande miljö fylld av kompetens och nyfikenhet. Karolinska Institutet är ett av världens ledande medicinska universitet. Här bedriver vi framgångsrik medicinsk forskning och har det största utbudet av medicinska utbildningar i Sverige. På KI får du träffa forskare med olika forskningsinriktningar som jobbar tillsammans. Det är det gränsöverskridande samarbetet som bidrar till KI:s världsledande position inom forskning. Som doktorand erbjuds du ett individuellt forskningsprojekt, en välutbildad handledare, ett stort utbud av valbara kurser och möjligheten att arbeta i en framgångsrik forskargrupp. Karolinska Institutet har samarbeten med framstående universitet över hela världen, vilket ger möjlighet till internationella utbyten. Som anställd doktorand får du en avtalsenlig lön, du får träna fritt i våra moderna friskvårdsanläggningar och du får ersättning för läkarvård.

Behörighetskrav för utbildning på forskarnivå

För att delta i urvalet till en doktorandplats måste du styrka både det grundläggande (A) och det särskilda (B) behörighetskravet innan ansökningsperioden stänger.

Det är ditt ansvar som sökande att styrka din behörighet genom att följa instruktionerna på webbsidan Behörighet till utbildning på forskarnivå.

A) Grundläggande behörighetskrav

Du uppfyller det grundläggande behörighetskravet för utbildning på forskarnivå om du:

1. har avlagt en examen på avancerad nivå (magister- eller masterexamen), eller
2. har fullgjort kursfordringar om minst 240 högskolepoäng, varav minst 60 högskolepoäng på avancerad nivå, eller
3. har på annat sätt förvärvat i huvudsak motsvarande kunskaper.*

Följ instruktionerna på webbsidan Behörighet till utbildning på forskarnivå.

*Om du anser dig ha motsvarande kunskaper ska du följa instruktionerna på webbsidan Bedömning av motsvarande kunskaper för grundläggande behörighet till utbildning på forskarnivå.

B) Särskilt behörighetskrav

Du uppfyller det särskilda behörighetskravet för utbildning på forskarnivå om du:

- Intygar kunskaper i engelska (motsvarande Engelska B/Engelska 6 vid gymnasiet med godkänt betyg).

Följ instruktionerna på webbsidan English language requirements for doctoral education.

Kontroll av dokument Karolinska Institutet gör kontroll av dokumenten för att upptäcka förfalskningar. Karolinska Institutet förbehåller sig rätten att återkalla antagningsbeslut om förfalskningar eller oriktigheter påvisas. Inlämnande av falska handlingar är ett brott mot svensk lag och anses vara grund för rättsliga åtgärder.

Färdigheter och personliga egenskaper

Nödvändiga kvalifikationer

• Erfarenhet av kvantitativ dataanalys och statistiskt resonemang
• Goda kunskaper i Python
• Stark analytisk förmåga och intresse för tvärvetenskaplig forskning i gränslandet mellan AI och medicin
• Utmärkt skriftlig och muntlig engelska
• Ett starkt personligt engagemang för att förbättra cancervården
• Mycket god kommunikativ förmåga, både skriftligt och muntligt, på engelska

Meriterande – Spår 1

• Erfarenhet av medicinska bilddata, särskilt mammografi eller bröst-MR
• Förståelse för riskprediktion, överlevnadsanalys eller beslutsmodellering
• Erfarenhet eller stort intresse för genetik, polygena riskpoäng eller ärftlig cancer
• Erfarenhet av träning eller finjustering av maskininlärnings- eller djupinlärningsmodeller
• Intresse för klinisk implementering och individualiserade övervakningsstrategier

Meriterande – Spår 2

• Bakgrund inom epidemiologi, folkhälsa, biostatistik eller liknande kvantitativa områden
• Erfarenhet av populationsbaserade eller registerdata
• Förståelse för subgruppsanalys, bias eller rättvisebedömning i statistiska eller ML-modeller
• Erfarenhet av träning eller finjustering av maskininlärningsmodeller är en stark merit
• Intresse för hälsoskillnader, ansvarsfull AI och policyrelevant forskning

Villkor

Doktorandplatsen innebär en anställning som doktorand under maximalt 4 år på heltid.

Ansökan

Du söker doktorandplatsen i rekryteringsverktyget Varbi. Använd knappen uppe till höger och följ anvisningarna. Vi ser gärna att din ansökan är skriven på engelska, men det går också bra att ansöka på svenska.

Din ansökan ska innehålla dessa dokument:

- Ett personligt brev och curriculum vitae 
- Eventuella examensarbeten och publikationer 
- Andra dokument som styrker de ovan efterfrågade färdigheter och egenskaper 
- Dokument som styrker det grundläggande behörighetskravet (se A ovan)
- Dokument som styrker det särskilda behörighetskravet (se B ovan)

Urval

Urval bland behöriga sökande görs med hänsyn till deras förmåga att tillgodogöra sig forskarutbildning. En samlad bedömning av de sökandes meriter och lämplighet kommer att göras.

Följande bedömningsgrunder tillämpas vid Karolinska Institutet:

- Dokumenterade ämneskunskaper av betydelse för forskningsområdet
- Analytisk skicklighet
- Övriga dokumenterade kunskaper/erfarenheter som kan ha betydelse för aktuell forskarutbildning  

Alla sökanden kommer att få information när rekryteringen är slutförd.

Ansök senast den 14 januari.

Vill du göra skillnad - och bidra till en bättre hälsa för alla? Sök till Karolinska Institutet