Doktorandplats inom exokrina körtlars biologi och gastrointestinal fysiologi/slemhinnans immunologi

Vill du bidra till medicinsk forskning av toppkvalitet?

Att vara doktorand innebär att vara antagen till en utbildning på forskarnivå (forskarutbildning) där man följer en individuell studieplan. En doktorand ägnar sig åt ett forskningsprojekt under handledning, kompletterat med kurser och andra lärandeaktiviteter. För en doktorsexamen krävs motsvarande fyra års utbildning på forskarnivå på heltid.

Forskargruppen

Laboratoriet för gastrointestinal och exokrin körtelbiologi (Monasterio Lab) är ett nybildat forskarteam inom Institutionen för medicin, Solna, vid Karolinska Institutet. Laboratoriet är en del av ett dynamiskt centrum för slemhinneimmunologi/spatial omik som delas med laboratorierna Villablanca och Engblom, vilket ger stark expertis inom både våt- och torrlaboratoriemetoder. Vi är belägna vid Centrum för molekylär medicin (CMM) vid Karolinska Universitetssjukhuset, en livlig translationell miljö som samlar grundforskare och kliniker och ger tillgång till toppmoderna kärnanläggningar och infrastruktur.

Vår forskning fokuserar på det nya konceptet att salivkörtlarna inte bara är tillbehörsorgan med lokala roller i munhålan, utan viktiga regulatorer av hela kroppens fysiologi. Baserat på våra fynd som identifierar en axel mellan tarmen och salivkörtlarna som är involverad i anpassningen till tarminflammation, tillsammans med växande bevis inom området, föreslår vi att salivkörtlarna fungerar som dubbla exokrina/endokrina organ och agerar som tidigare förbisedda reostater i systemiska fysiologiska kretsar. Vårt övergripande mål är att mekanistiskt analysera hur salivkörtlarna påverkar aerodigestiv och systemisk fysiologi. För att ta itu med detta bygger vi ett forskningsprogram som integrerar explorativa, omikdrivna strategier (Monasterio et al., Nature Protocols, 2024) med hypotesdrivna mekanistiska arbeten (Frede, Czarnewski, Monasterio et al., Immunity, 2022) för att avslöja okonventionella funktioner hos salivkörtlarna i luft- och matsmältningsbarriärerna vid hälsa och sjukdom. På lång sikt är vårt mål att omsätta dessa insikter i nya diagnostiska, prognostiska och terapeutiska möjligheter för mänskliga sjukdomar, inklusive inflammatoriska tillstånd och cancer.

För att uppnå dessa mål använder vi multi-omikplattformar (transkriptomik, proteomik, metabolomik) för att på ett objektivt sätt undersöka hur störningar som inflammation, mikrobiota, kost och tumörer omformar salivkörtlarnas funktion – och hur körtlarnas reaktioner i sin tur bidrar till organismens anpassning. För mekanistiska studier etablerar vi ett mångsidigt experimentellt verktygsset som inkluderar konventionella molekylärbiologiska metoder, konfokal och ljusarkavbildning, djurmodeller för störningar i luft- och matsmältningssystemet (inflammation, cancer, infektioner), kirurgiska och mikrokirurgiska ingrepp samt virusmedierad genmanipulation in vitro och in vivo. Laboratoriet stöds dessutom av ett starkt nätverk av lokala och internationella samarbetspartners som tillhandahåller kompletterande expertis, inklusive genöverföring i salivkörtlar, neural spårning och manipulation, virusinfektioner i övre luftvägarna och biologi hos mänskliga salivkörtlar, med möjligheter till kort- och långvariga forskningsvistelser utomlands.

Som team är vi engagerade i att främja en hälsosam, inkluderande och öppen akademisk miljö. Vi deltar aktivt i initiativ som främjar konstruktiv och samarbetsinriktad vetenskap och stöder praktikanters karriärutveckling. Nyfikenhet, noggrannhet, lagarbete och en genuin drivkraft för upptäckter är centrala delar i vår laboratoriekultur, och vi strävar efter att erbjuda en stödjande miljö där doktorander kan utvecklas både vetenskapligt och personligt.

Doktorandprojektet och doktorandens uppgifter

Vårt laboratorium fokuserar på att belysa biologin hos ett nytt organ hos däggdjur som vi har upptäckt. Detta doktorandprojekt kommer att definiera organets organisation, funktion och reglering samt fastställa hur det interagerar med luft- och matsmältningssystemen hos både möss och människor.

Projektet integrerar en bred uppsättning experimentella och beräkningsmässiga metoder, och kombinerar väl etablerade metoder i laboratoriet med nya tekniker som utvecklats genom våra lokala och internationella samarbeten. Doktoranden kommer att vara engagerad i hela forskningscykeln – från att utveckla hypoteser, utforma och genomföra experiment, analysera och tolka data till att presentera resultaten. Tjänsten består av cirka 80 % laboratoriearbete och 20 % bioinformatik. Under projektets gång förväntas studenten utveckla en grundläggande självständighet inom bioinformatiska analyser. Med stöd av erfarna bioinformatiker i den lokala miljön, internationella samarbetspartners och nationella resurser (t.ex. NBIS) kommer studenten också att bidra till databashantering och databehandling.

Utbildningen kommer att omfatta praktiskt arbete med molekylära och cellulära tekniker, djurmodeller och toppmoderna spatiala omikstekniker. Studenten kommer att vidareutveckla sina vetenskapliga kommunikationsfärdigheter genom aktivt deltagande i manuskriptförberedelser, konferenspresentationer och andra informationsspridningsaktiviteter.

Vad erbjuder vi? 

En kreativ, internationell och inspirerande miljö fylld av kompetens och nyfikenhet. Karolinska Institutet är ett av världens ledande medicinska universitet. Här bedriver vi framgångsrik medicinsk forskning och har det största utbudet av medicinska utbildningar i Sverige. På KI får du träffa forskare med olika forskningsinriktningar som jobbar tillsammans. Det är det gränsöverskridande samarbetet som bidrar till KI:s världsledande position inom forskning. Som doktorand erbjuds du ett individuellt forskningsprojekt, en välutbildad handledare, ett stort utbud av valbara kurser och möjligheten att arbeta i en framgångsrik forskargrupp. Karolinska Institutet har samarbeten med framstående universitet över hela världen, vilket ger möjlighet till internationella utbyten. Som anställd doktorand får du en avtalsenlig lön, du får träna fritt i våra moderna friskvårdsanläggningar och du får ersättning för läkarvård.

Behörighetskrav för utbildning på forskarnivå

För att delta i urvalet till en doktorandplats måste du styrka både det grundläggande (A) och det särskilda (B) behörighetskravet innan ansökningsperioden stänger.

Det är ditt ansvar som sökande att styrka din behörighet genom att följa instruktionerna på webbsidan Behörighet till utbildning på forskarnivå.

A) Grundläggande behörighetskrav

Du uppfyller det grundläggande behörighetskravet för utbildning på forskarnivå om du:

1. har avlagt en examen på avancerad nivå (magister- eller masterexamen), eller
2. har fullgjort kursfordringar om minst 240 högskolepoäng, varav minst 60 högskolepoäng på avancerad nivå, eller
3. har på annat sätt förvärvat i huvudsak motsvarande kunskaper.*

Följ instruktionerna på webbsidan Behörighet till utbildning på forskarnivå.

*Om du anser dig ha motsvarande kunskaper ska du följa instruktionerna på webbsidan Bedömning av motsvarande kunskaper för grundläggande behörighet till utbildning på forskarnivå.

B) Särskilt behörighetskrav

Du uppfyller det särskilda behörighetskravet för utbildning på forskarnivå om du:

- Intygar kunskaper i engelska (motsvarande Engelska B/Engelska 6 vid gymnasiet med godkänt betyg).

Följ instruktionerna på webbsidan English language requirements for doctoral education.

Kontroll av dokument Karolinska Institutet gör kontroll av dokumenten för att upptäcka förfalskningar. Karolinska Institutet förbehåller sig rätten att återkalla antagningsbeslut om förfalskningar eller oriktigheter påvisas. Inlämnande av falska handlingar är ett brott mot svensk lag och anses vara grund för rättsliga åtgärder.

Färdigheter och personliga egenskaper

Vi söker en motiverad doktorand inom biomedicin med intresse för interorganisk kommunikation, slemhinneimmunologi och hur organismer anpassar sig till miljö- och inflammatoriska utmaningar. Den ideala kandidaten har en bakgrund inom cell- och molekylärbiologi eller relaterade områden, samt praktisk erfarenhet av standardlaboratorietekniker såsom genotypning, nukleinsyraextraktion, qRT-PCR, däggdjurscellodling och in vitro-analyser. Erfarenhet eller ett starkt intresse för systemfysiologi, slemhinneimmunologi och exokrin eller endokrin biologi, samt för spatial transkriptomik och metabolomik, ses som en fördel. Ytterligare meriter inkluderar praktiska färdigheter inom djurarbete (särskilt kirurgiska ingrepp), immunofluorescens och andra bildbaserade tekniker, proteinkvantifiering och viral transduktion av däggdjurs- eller humana cellinjer eller primära celler, samt förtrogenhet med bioinformatisk analys av metabolomik, bulk- och encells-RNA-sekvensering och/eller rumsliga omikdatasätt. Den framgångsrika kandidaten kan tydligt analysera, tolka och presentera forskningsdata, är intresserad av vetenskapligt skrivande och publiceringsprocessen och är fast besluten att följa forskningsetiken. På ett personligt plan söker vi en engagerad, nyfiken och proaktiv lagspelare som trivs i en samarbetsinriktad, internationell miljö, kommunicerar effektivt på engelska, är öppen för feedback, delar generöst med sig av sin kunskap och också kan planera, prioritera och driva projekt självständigt samtidigt som överenskomna deadlines hålls.

Villkor

Doktorandplatsen innebär en anställning som doktorand under maximalt 4 år på heltid.

--[Video om Karolinska Institutet, hur vi alla bidrar till en bättre hälsa för alla] ---

Ansökan

Du söker doktorandplatsen i rekryteringsverktyget Varbi. Använd knappen uppe till höger och följ anvisningarna. Vi ser gärna att din ansökan är skriven på engelska, men det går också bra att ansöka på svenska.

Din ansökan ska innehålla dessa dokument:

- Ett personligt brev och curriculum vitae 
- Eventuella examensarbeten och publikationer 
- Andra dokument som styrker de ovan efterfrågade färdigheter och egenskaper 
- Dokument som styrker det grundläggande behörighetskravet (se A ovan)
- Dokument som styrker det särskilda behörighetskravet (se B ovan)

Urval

Urval bland behöriga sökande görs med hänsyn till deras förmåga att tillgodogöra sig forskarutbildning. En samlad bedömning av de sökandes meriter och lämplighet kommer att göras.

Följande bedömningsgrunder tillämpas vid Karolinska Institutet:

- Dokumenterade ämneskunskaper av betydelse för forskningsområdet
- Analytisk skicklighet
- Övriga dokumenterade kunskaper/erfarenheter som kan ha betydelse för aktuell forskarutbildning  

Alla sökanden kommer att få information när rekryteringen är slutförd.

https://ki.se/en/people/gustavo-monasterio

CMM

Vill du göra skillnad - och bidra till en bättre hälsa för alla? Sök till Karolinska Institutet