Doktorandtjänst – Beräkningsneurovetenskap och systembiologi. Tema: Neurala dynamiker som styr överlevnadsbeteenden

Vill du bidra till medicinsk forskning av toppkvalitet?

Att vara doktorand innebär att vara antagen till en utbildning på forskarnivå (forskarutbildning) där man följer en individuell studieplan. En doktorand ägnar sig åt ett forskningsprojekt under handledning, kompletterat med kurser och andra lärandeaktiviteter. För en doktorsexamen krävs motsvarande fyra års utbildning på forskarnivå på heltid.

Doktorandprojektet och doktorandens uppgifter

Är du passionerad kring att förstå hur neurala kretsar genererar beteende?
Stagkourakis-laboratoriet vid Karolinska Institutet och SciLifeLab i Stockholm rekryterar nu en doktorand i beräkningsneurovetenskap. Laboratoriet är baserat vid Institutionen för neurovetenskap (Biomedicum) och är en del av SciLifeLab, Sveriges nationella centrum för storskalig molekylär biovetenskap och datadriven livsvetenskap.

Vårt mål är att identifiera de neuronala och neurohormonella principer som ligger till grund för instinktiva och homeostatiska beteenden, såsom aggression, rädsla, födointag och sociala interaktioner.

Vi söker en kandidat som vill bidra till analys och modellering av storskaliga neurala populationsinspelningar som erhållits under naturliga beteenden hos fritt rörliga djur. Projektet integrerar metoder inom nätverksteori, dynamiska system och maskininlärning för att förstå hur distribuerade neuronala nätverk kodar inre tillstånd och styr överlevnadsbeteenden.

Om laboratoriet

Vår forskning kombinerar storskalig in vivo-elektrofysiologi (Neuropixels), tvåfotonmikroskopi, optogenetik och beräkningsmodellering för att avslöja principerna bakom hur neurala kretsar fungerar. Vi har ett starkt fokus på teknisk innovation, beteendemässig precision och datadriven upptäckt, och vårt laboratorium är en del av en tvärvetenskaplig miljö som förenar experimentell och teoretisk neurovetenskap.

Vad erbjuder vi? 

En kreativ, internationell och inspirerande miljö fylld av kompetens och nyfikenhet. Karolinska Institutet är ett av världens ledande medicinska universitet. Här bedriver vi framgångsrik medicinsk forskning och har det största utbudet av medicinska utbildningar i Sverige. På KI får du träffa forskare med olika forskningsinriktningar som jobbar tillsammans. Det är det gränsöverskridande samarbetet som bidrar till KI:s världsledande position inom forskning. Som doktorand erbjuds du ett individuellt forskningsprojekt, en välutbildad handledare, ett stort utbud av valbara kurser och möjligheten att arbeta i en framgångsrik forskargrupp. Karolinska Institutet har samarbeten med framstående universitet över hela världen, vilket ger möjlighet till internationella utbyten. Som anställd doktorand får du en avtalsenlig lön, du får träna fritt i våra moderna friskvårdsanläggningar och du får ersättning för läkarvård.

• En kreativ, samarbetande och välutrustad forskningsmiljö
• Tillgång till toppmodern infrastruktur vid Karolinska Institutet och SciLifeLab
• Utbildning inom avancerad beräkningsneurovetenskap, nätverksteori och datavetenskap
• Möjlighet till tvärvetenskapligt samarbete med forskare som genererar storskaliga experimentella dataset
• Aktivt deltagande i projekt med hög vetenskaplig och translationell relevans för neuropsykiatriska sjukdomar

Behörighetskrav för utbildning på forskarnivå

För att delta i urvalet till en doktorandplats måste du styrka både det grundläggande (A) och det särskilda (B) behörighetskravet innan ansökningsperioden stänger.

Det är ditt ansvar som sökande att styrka din behörighet genom att följa instruktionerna på webbsidan Behörighet till utbildning på forskarnivå.

A) Grundläggande behörighetskrav

Du uppfyller det grundläggande behörighetskravet för utbildning på forskarnivå om du:

1. har avlagt en examen på avancerad nivå (magister- eller masterexamen), eller
2. har fullgjort kursfordringar om minst 240 högskolepoäng, varav minst 60 högskolepoäng på avancerad nivå, eller
3. har på annat sätt förvärvat i huvudsak motsvarande kunskaper.*

Följ instruktionerna på webbsidan Behörighet till utbildning på forskarnivå.

*Om du anser dig ha motsvarande kunskaper ska du följa instruktionerna på webbsidan Bedömning av motsvarande kunskaper för grundläggande behörighet till utbildning på forskarnivå.

B) Särskilt behörighetskrav

Du uppfyller det särskilda behörighetskravet för utbildning på forskarnivå om du:

- Intygar kunskaper i engelska (motsvarande Engelska B/Engelska 6 vid gymnasiet med godkänt betyg).

Följ instruktionerna på webbsidan English language requirements for doctoral education.

Kontroll av dokument Karolinska Institutet gör kontroll av dokumenten för att upptäcka förfalskningar. Karolinska Institutet förbehåller sig rätten att återkalla antagningsbeslut om förfalskningar eller oriktigheter påvisas. Inlämnande av falska handlingar är ett brott mot svensk lag och anses vara grund för rättsliga åtgärder.

Färdigheter och personliga egenskaper

Sökandeprofil

Vi söker en motiverad och kreativ student med stark kvantitativ bakgrund och ett djupt intresse för neural beräkning och beteende.

Den ideala kandidaten tycker om att formulera modeller utifrån data, utveckla analytiska verktyg och integrera teori med experiment.

Behörighetskrav

• Examen på masternivå (eller motsvarande) i beräkningsneurovetenskap, fysik, tillämpad matematik, datavetenskap, bioingenjörsvetenskap eller närliggande område.
• Goda kunskaper i programmering och dataanalys (Python, MATLAB eller Julia).
• Erfarenhet av storskalig dataanalys, signalbehandling eller statistisk modellering.
• Förmåga att arbeta både självständigt och i tvärvetenskapliga samarbeten.

Meriterande (en eller flera av följande):

• Kunskap inom dynamiska system, nätverksvetenskap eller maskininlärning tillämpad på neurovetenskap.
• Erfarenhet av analys av neurala populationer (t.ex. PCA, UMAP, GLM, HMM eller nätverksmodeller).
• Erfarenhet av tidsserieanalys, tillståndsrymdsmodellering eller kausal inferens.
• Intresse för att koppla neural aktivitet till beteende med hjälp av multimodala dataset.
• Grundläggande erfarenhet av versionshantering (Git) och reproducerbara datapipelines.

Plats

• Biomedicum D8, Institutionen för neurovetenskap, Karolinska Institutet, Solnavägen 9, Solna
• SciLifeLab Gamma 5, Tomtebodavägen 23A, Solna

Villkor

Doktorandplatsen innebär en anställning som doktorand under maximalt 4 år på heltid.

Ansökan

Du söker doktorandplatsen i rekryteringsverktyget Varbi. Använd knappen uppe till höger och följ anvisningarna. Vi ser gärna att din ansökan är skriven på engelska, men det går också bra att ansöka på svenska.

Din ansökan ska innehålla dessa dokument:

- Ett personligt brev och curriculum vitae 
- Eventuella examensarbeten och publikationer 
- Andra dokument som styrker de ovan efterfrågade färdigheter och egenskaper 
- Dokument som styrker det grundläggande behörighetskravet (se A ovan)
- Dokument som styrker det särskilda behörighetskravet (se B ovan)

Vi uppmuntrar att kandidater skickar in sin ansökan så snart som möjligt. 

Urval

Urval bland behöriga sökande görs med hänsyn till deras förmåga att tillgodogöra sig forskarutbildning. En samlad bedömning av de sökandes meriter och lämplighet kommer att göras.

Följande bedömningsgrunder tillämpas vid Karolinska Institutet:

- Dokumenterade ämneskunskaper av betydelse för forskningsområdet
- Analytisk skicklighet
- Övriga dokumenterade kunskaper/erfarenheter som kan ha betydelse för aktuell forskarutbildning  

Alla sökanden kommer att få information när rekryteringen är slutförd.

För en kort översikt av laboratoriet och vår forskning, se här.

Vill du göra skillnad - och bidra till en bättre hälsa för alla? Sök till Karolinska Institutet