Doktorandplats inom adipocyt-systembiologi

Vill du bidra till medicinsk forskning av toppkvalitet?

Att vara doktorand innebär att vara antagen till en utbildning på forskarnivå (forskarutbildning) där man följer en individuell studieplan. En doktorand ägnar sig åt ett forskningsprojekt under handledning, kompletterat med kurser och andra lärandeaktiviteter. För en doktorsexamen krävs motsvarande fyra års utbildning på forskarnivå på heltid.

Forskargruppen

Rydén- och Mejhert-laboratoriet undersöker hur förändringar i human vit adipocytfunktion bidrar till kardiometabola sjukdomar, inklusive typ 2-diabetes, dyslipidemi och ateroskleros. Vårt tvärvetenskapliga team består av 15–20 medlemmar, inklusive postdoktorer, doktorander, masterstudenter och teknisk personal, och bedriver banbrytande translationell forskning. Vi har tillgång till toppmoderna faciliteter, inklusive ett omfattande prekliniskt laboratorium vid KI Campus Flemingsberg och en klinisk forskningsenhet vid Karolinska Universitetssjukhuset i Huddinge, vilket möjliggör en smidig integration från grundforskning till klinisk tillämpning.

Doktorandprojektet och doktorandens uppgifter

Vi söker en högmotiverad och ambitiös doktorand till vårt laboratorium. Doktoranden kommer att arbeta med ett forskningsprojekt som syftar till att kartlägga den cellulära mikroarkitekturen i human vit adipos vävnad (WAT) och förstå hur den påverkas av typ 2-diabetes, kardiovaskulära sjukdomar och moderna perorala antihyperglykemiska läkemedel. Studenten kommer att använda toppmoderna teknologier såsom enkelkärnig RNA-sekvensering (snSeq) och spatial transkriptomik (STx) för att kartlägga cellpopulationer och deras rumsliga organisation i WAT-depåer. Dessa resultat kommer att analyseras tillsammans med data om kromatin-tillgänglighet. En central del av projektet innebär att integrera dessa dataset med kliniska och funktionella bedömningar, vilket kräver avancerade bioinformatiska analyser i R och Python.

Studenten kommer att få expertis inom högkapacitetssekvensering, bioinformatik och maskininlärningsbaserade dekonvolutionsmetoder för att analysera bulk-RNA-sekvenseringsdata. Utöver det beräkningsbaserade arbetet kommer nyckelfynd att valideras på proteinnivå med standardmetoder inom våtlaboratorium. Det finns även möjligheter att delta i pågående kliniska studier och lära sig om patientrekrytering, provtagning och metabola fenotypningsmetoder, inklusive hyperinsulinemiska-euglykemiska klampar. Projektet är mycket tvärvetenskapligt och innefattar samarbeten med ledande forskare inom metabolism, bioinformatik och klinisk medicin, vilket ger studenten en stark grund inom translationell forskning.

Vad erbjuder vi? 

En kreativ, internationell och inspirerande miljö fylld av kompetens och nyfikenhet. Karolinska Institutet är ett av världens ledande medicinska universitet. Här bedriver vi framgångsrik medicinsk forskning och har det största utbudet av medicinska utbildningar i Sverige. På KI får du träffa forskare med olika forskningsinriktningar som jobbar tillsammans. Det är det gränsöverskridande samarbetet som bidrar till KI:s världsledande position inom forskning. Som doktorand erbjuds du ett individuellt forskningsprojekt, en välutbildad handledare, ett stort utbud av valbara kurser och möjligheten att arbeta i en framgångsrik forskargrupp. Karolinska Institutet har samarbeten med framstående universitet över hela världen, vilket ger möjlighet till internationella utbyten. Som anställd doktorand får du en avtalsenlig lön, du får träna fritt i våra moderna friskvårdsanläggningar och du får ersättning för läkarvård.

Behörighetskrav för utbildning på forskarnivå

För att delta i urvalet till en doktorandplats måste du styrka både det grundläggande (A) och det särskilda (B) behörighetskravet innan ansökningsperioden stänger.

Det är ditt ansvar som sökande att styrka din behörighet genom att följa instruktionerna på webbsidan Behörighet till utbildning på forskarnivå.

A) Grundläggande behörighetskrav

Du uppfyller det grundläggande behörighetskravet för utbildning på forskarnivå om du:

1. har avlagt en examen på avancerad nivå (magister- eller masterexamen), eller
2. har fullgjort kursfordringar om minst 240 högskolepoäng, varav minst 60 högskolepoäng på avancerad nivå, eller
3. har på annat sätt förvärvat i huvudsak motsvarande kunskaper.*

Följ instruktionerna på webbsidan Behörighet till utbildning på forskarnivå.

*Om du anser dig ha motsvarande kunskaper ska du följa instruktionerna på webbsidan Bedömning av motsvarande kunskaper för grundläggande behörighet till utbildning på forskarnivå.

B) Särskilt behörighetskrav

Du uppfyller det särskilda behörighetskravet för utbildning på forskarnivå om du:

- Intygar kunskaper i engelska (motsvarande Engelska B/Engelska 6 vid gymnasiet med godkänt betyg).

Följ instruktionerna på webbsidan English language requirements for doctoral education.

Kontroll av dokument Karolinska Institutet gör kontroll av dokumenten för att upptäcka förfalskningar. Karolinska Institutet förbehåller sig rätten att återkalla antagningsbeslut om förfalskningar eller oriktigheter påvisas. Inlämnande av falska handlingar är ett brott mot svensk lag och anses vara grund för rättsliga åtgärder.

Färdigheter och personliga egenskaper

Den ideala kandidaten bör ha en stark bakgrund inom systembiologi, med erfarenhet av nästa generations sekvenseringstekniker, särskilt singelcells-RNA-sekvensering och spatial transkriptomik.

Kunskap inom bioinformatik är avgörande, inklusive expertis i dataanalys med R och/eller Python för att bearbeta och tolka transkriptomiska och kromatinåtkomstdata.

Förutom tekniska färdigheter bör kandidaten ha starka analytiska och problemlösningsförmågor, vilket möjliggör arbete med storskaliga dataset och tillämpning av beräkningsverktyg för kvalitetskontroll, klustring och integrering av multi-omics-data. Ett strukturerat och detaljorienterat arbetssätt vid experimentell design, datahantering och tolkning av resultat är avgörande.

På ett personligt plan bör den framgångsrika sökanden vara proaktiv och kunna arbeta självständigt, samtidigt som de är en utmärkt lagspelare. Med tanke på projektets samarbetsnatur är interpersonella färdigheter och förmågan att kommunicera effektivt med bioinformatiker, kliniker och laboratorieforskare viktiga. Entusiasm för tvärvetenskaplig forskning och en vilja att utveckla nya färdigheter värderas högt.

Tidigare erfarenhet av hantering av kliniska prover, bulk-RNA-sekvensering eller proteomiska analyser är meriterande men inget krav.

Villkor

Doktorandplatsen innebär en anställning som doktorand under maximalt 4 år på heltid.

Ansökan

Du söker doktorandplatsen i rekryteringsverktyget Varbi. Använd knappen uppe till höger och följ anvisningarna. Vi ser gärna att din ansökan är skriven på engelska, men det går också bra att ansöka på svenska.

Din ansökan ska innehålla dessa dokument:

- Ett personligt brev och curriculum vitae 
- Eventuella examensarbeten och publikationer 
- Andra dokument som styrker de ovan efterfrågade färdigheter och egenskaper 
- Dokument som styrker det grundläggande behörighetskravet (se A ovan)
- Dokument som styrker det särskilda behörighetskravet (se B ovan)

Urval

Urval bland behöriga sökande görs med hänsyn till deras förmåga att tillgodogöra sig forskarutbildning. En samlad bedömning av de sökandes meriter och lämplighet kommer att göras.

Följande bedömningsgrunder tillämpas vid Karolinska Institutet:

- Dokumenterade ämneskunskaper av betydelse för forskningsområdet
- Analytisk skicklighet
- Övriga dokumenterade kunskaper/erfarenheter som kan ha betydelse för aktuell forskarutbildning  

Alla sökanden kommer att få information när rekryteringen är slutförd.

Rydén and Mejhert laboratory 

Vill du göra skillnad - och bidra till en bättre hälsa för alla? Sök till Karolinska Institutet