Doktorandplats inom Utvecklingsbiologi med in utero next generation single cell lineage tracing

Vill du bidra till medicinsk forskning av toppkvalitet?

Att vara doktorand innebär att vara antagen till en utbildning på forskarnivå (forskarutbildning) där man följer en individuell studieplan. En doktorand ägnar sig åt ett forskningsprojekt under handledning, kompletterat med kurser och andra lärandeaktiviteter. För en doktorsexamen krävs motsvarande fyra års utbildning på forskarnivå på heltid.

Forskargruppen

Andersson-labbet är dedikerat till att avslöja mekanismerna som styr hur organsystem utvecklar sina korrekta cellidentiteter och arkitekturer. Som utvecklingsbiologer undersöker vi varför och hur genetiska mutationer leder till specifika defekter under embryogenesen. Vår forskning betonar innovation, då vi utvecklar nya metoder för att analysera organarkitektur och banbrytande teknologier för att manipulera genuttryck och embryonal utveckling i möss. Vårt mål är att fördjupa förståelsen av grundläggande utvecklingsprocesser samtidigt som vi bidrar med insikter som är relevanta för mänsklig hälsa. Labbet stöds av Vetenskapsrådet, Knut och Alice Wallenbergs Stiftelse och Europeiska forskningsrådet (ERC), bland andra. Andersson-labbet är en del av Institutionen för cell- och molekylärbiologi vid Karolinska Institutet, beläget på Solna-campus, i Biomedicumbyggnaden.

Doktorandprojektet och doktorandens uppgifter

Vi söker en motiverad postdoktoral forskare till ett innovativt ERC-finansierat projekt. Målet är att kartlägga embryonala cellöden med en oöverträffad upplösning. Projektet bygger på vår etablering av in utero-injektion för att manipulera nervsystemet (Mangold et al., 2021), en metod vi tillämpade för att spåra neuralistens öden med virala streckkoder, i samarbete (Kameneva & Artemov et al., 2021), och som kan kombineras med spatial transkriptomik (Ratz et al., 2022). Projektet omfattar optimering och automatisering av in utero-nano-injektionsmetoder för att manipulera multipotenta celler i tidiga utvecklingsstadier, vilket möjliggör precis manipulation och spårning av cellöden. Avancerade tekniker, inklusive enkelscells-RNA-sekvensering, spatial transkriptomik och lentiviral streckkodning, kommer att användas för att rekonstruera cellöden och avslöja cellödesdynamik. Kandidaten kommer att använda bioinformatiska pipelines för att lösa embryonala linjer baserat på embryonal streckkodning och förväntas ligga i framkant av nästa generations tekniker för enkelscells spårning.

Den framgångsrika kandidaten kommer att arbeta i en samarbetsinriktad och tvärvetenskaplig miljö med tillgång till världsledande faciliteter och expertis inom utvecklingsbiologi, genetik och beräkningsanalys.

ERC har lyft fram projektet som ett exempel på finansierad forskning, för mer information, vänligen se:
https://erc.europa.eu/news-events/news/consolidator-grants-2024-examples-projects#LIMITLESS
Se även: https://news.ki.se/four-ki-researchers-awarded-2024-erc-consolidator-grant

Vad erbjuder vi? 

En kreativ, internationell och inspirerande miljö fylld av kompetens och nyfikenhet. Karolinska Institutet är ett av världens ledande medicinska universitet. Här bedriver vi framgångsrik medicinsk forskning och har det största utbudet av medicinska utbildningar i Sverige. På KI får du träffa forskare med olika forskningsinriktningar som jobbar tillsammans. Det är det gränsöverskridande samarbetet som bidrar till KI:s världsledande position inom forskning. Som doktorand erbjuds du ett individuellt forskningsprojekt, en välutbildad handledare, ett stort utbud av valbara kurser och möjligheten att arbeta i en framgångsrik forskargrupp. Karolinska Institutet har samarbeten med framstående universitet över hela världen, vilket ger möjlighet till internationella utbyten. Som anställd doktorand får du en avtalsenlig lön, du får träna fritt i våra moderna friskvårdsanläggningar och du får ersättning för läkarvård.

Behörighetskrav för utbildning på forskarnivå

För att delta i urvalet till en doktorandplats måste du styrka både det grundläggande (A) och det särskilda (B) behörighetskravet innan ansökningsperioden stänger.

Det är ditt ansvar som sökande att styrka din behörighet genom att följa instruktionerna på webbsidan Behörighet till utbildning på forskarnivå.

A) Grundläggande behörighetskrav

Du uppfyller det grundläggande behörighetskravet för utbildning på forskarnivå om du:

1. har avlagt en examen på avancerad nivå (magister- eller masterexamen), eller
2. har fullgjort kursfordringar om minst 240 högskolepoäng, varav minst 60 högskolepoäng på avancerad nivå, eller
3. har på annat sätt förvärvat i huvudsak motsvarande kunskaper.*

Följ instruktionerna på webbsidan Behörighet till utbildning på forskarnivå.

*Om du anser dig ha motsvarande kunskaper ska du följa instruktionerna på webbsidan Bedömning av motsvarande kunskaper för grundläggande behörighet till utbildning på forskarnivå.

B) Särskilt behörighetskrav

Du uppfyller det särskilda behörighetskravet för utbildning på forskarnivå om du:

- Intygar kunskaper i engelska (motsvarande Engelska B/Engelska 6 vid gymnasiet med godkänt betyg).

Följ instruktionerna på webbsidan English language requirements for doctoral education.

Kontroll av dokument Karolinska Institutet gör kontroll av dokumenten för att upptäcka förfalskningar. Karolinska Institutet förbehåller sig rätten att återkalla antagningsbeslut om förfalskningar eller oriktigheter påvisas. Inlämnande av falska handlingar är ett brott mot svensk lag och anses vara grund för rättsliga åtgärder.

Färdigheter och personliga egenskaper

Vi söker en kreativ, analytisk och ambitiös kandidat med ett starkt intresse för att utveckla och tillämpa innovativa metoder inom livsvetenskaperna. Erfarenhet av, eller en vilja att lära sig arbeta med möss, är en viktig del av rollen. Dina arbetsuppgifter kommer att omfatta både praktiska laboratorieexperiment och användning av beräkningsverktyg för att analysera data och dra meningsfulla slutsatser.

Du kommer att ingå i ett multidisciplinärt och internationellt team och samarbeta nära med andra forskargrupper. Därför är det viktigt att kandidaten kan ta initiativ, kommunicera effektivt och arbeta proaktivt med kollegor för att uppnå forskningsmål.

Vi välkomnar kandidater med expertis eller ett dokumenterat intresse för utvecklingsbiologi och transkriptomik. Erfarenhet av R, Python, Jupyter eller liknande beräkningsverktyg är en fördel men inget krav. Som doktorand kommer du att få lära dig de flesta av de nödvändiga färdigheterna under dina doktorandstudier. Därför är de viktigaste egenskaperna vi söker en stark förmåga att snabbt ta till sig ny kunskap, en öppenhet för feedback och en djup nyfikenhet för att utforska nya områden.

Villkor

Doktorandplatsen innebär en anställning som doktorand under maximalt 4 år på heltid.

--[Video om Karolinska Institutet, hur vi alla bidrar till en bättre hälsa för alla] ---

Ansökan

Du söker doktorandplatsen i rekryteringsverktyget Varbi. Använd knappen uppe till höger och följ anvisningarna. Vi ser gärna att din ansökan är skriven på engelska, men det går också bra att ansöka på svenska.

Din ansökan ska innehålla dessa dokument:

- Ett personligt brev och ett CV (på svenska eller engelska). Det personliga brevet ska förklara varför kandidaten är intresserad av utvecklingsbiologi och lineage tracing samt vilka frågor studenten anser är intressanta att undersöka inom detta projekt. Brevet ska också beskriva studentens perspektiv på användningen av generativa AI-verktyg, såsom ChatGPT, till exempel under projektets gång. Om AI verktyg används i skapandet av ansökan, beskriv då hur verktyget använts. 
- Eventuella examensarbeten och publikationer 
- Andra dokument som styrker de ovan efterfrågade färdigheter och egenskaper 
- Dokument som styrker det grundläggande behörighetskravet (se A ovan)
- Dokument som styrker det särskilda behörighetskravet (se B ovan)

Urval

Urval bland behöriga sökande görs med hänsyn till deras förmåga att tillgodogöra sig forskarutbildning. En samlad bedömning av de sökandes meriter och lämplighet kommer att göras.

Följande bedömningsgrunder tillämpas vid Karolinska Institutet:

- Dokumenterade ämneskunskaper av betydelse för forskningsområdet
- Analytisk skicklighet
- Övriga dokumenterade kunskaper/erfarenheter som kan ha betydelse för aktuell forskarutbildning  

Alla sökanden kommer att få information när rekryteringen är slutförd.

[Lägg in länkar här – bör vara max 2 stycken, t ex länk till institutionen, forskargruppen eller till Din karriär fortsätter här]

Vill du göra skillnad - och bidra till en bättre hälsa för alla? Sök till Karolinska Institutet