Doktorandplats inom användning av DNA för att kartlägga transskript och skapa mönster av biomolekyler

Vill du bidra till medicinsk forskning av toppkvalitet?

Att vara doktorand innebär att vara antagen till en utbildning på forskarnivå (forskarutbildning) där man följer en individuell studieplan. En doktorand ägnar sig åt ett forskningsprojekt under handledning, kompletterat med kurser och andra lärandeaktiviteter. För en doktorsexamen krävs motsvarande fyra års utbildning på forskarnivå på heltid.

Institutionen för mikrobiologi, tumör- och cellbiologi (MTC) vid Karolinska Institutet bedriver forskning och undervisning inom immunologi, infektionsbiologi, cellbiologi och cancer. MTC har cirka 40 forskargrupper och våra nyckelord är multidisciplinära, överbryggande, nationella och internationella samarbeten. 

Forskargruppen

Vi söker en doktorand till Erik Bensons forskargrupp baserad på Scilifelab campus Solna. Gruppen fokuserar på att använda DNA nanoteknik för att studera biologiska system. Vi vill använda detta för att studera den spatiala distributionen av transskript i celler och vävnader och för att skapa precisa mönster av funktionella proteiner för att studera virala infektioner. Som medlem i gruppen blir du en del av Scilifelab-gemenskapen och enheten för mikrobiologi-bakteriologi vid Karolinska Institutet.

Doktorandprojektet och doktorandens uppgifter

Under de senaste decennierna har det visat sig att nukleinsyror inte bara kan fungera som lagringsmedia för genetiskt material, utan också som byggstenar på nanoskalan. DNA nanoteknik bygger på självmontering av noggrant designat syntetiskt DNA och kan skapa både statiska objekt och mönster på nanoskalan samt dynamiska system som interagerar med nukleinsyror i celler och vävnader.

Vi söker en doktorand som ska använda både beräkningsmässiga och experimentella tekniker för att arbeta med två aspekter av DNA nanoteknik. Studenten kommer att arbeta som en del av ett europeiskt konsortium för att utveckla en självmonterad metod för rumslig kartläggning av transkriptomik baserat på konceptet DNA-mikroskopi. Här kommer DNA-nanoteknologi att användas för att lokalt amplifiera transskript för att bygga ett 3D-nätverk av sammankopplade transskript. Detta kommer att kombineras med sekvensering för att avkoda nätverkets kopplingar i syfte att försöka bygga en 3D-karta över transskript. För det andra kommer studenten att arbeta i samarbete med forskare vid institutionen för medicin för att producera DNA-origami nanostrukturer funktionaliserade med mönster av nanokroppar som binder till ytan av Henipavirusproteiner för att förstå deras cellinträdesmekanism.

Vad erbjuder vi? 

En kreativ, internationell och inspirerande miljö fylld av kompetens och nyfikenhet. Karolinska Institutet är ett av världens ledande medicinska universitet. Här bedriver vi framgångsrik medicinsk forskning och har det största utbudet av medicinska utbildningar i Sverige. På KI får du träffa forskare med olika forskningsinriktningar som jobbar tillsammans. Det är det gränsöverskridande samarbetet som bidrar till KI:s världsledande position inom forskning. Som doktorand erbjuds du ett individuellt forskningsprojekt, en välutbildad handledare, ett stort utbud av valbara kurser och möjligheten att arbeta i en framgångsrik forskargrupp. Karolinska Institutet har samarbeten med framstående universitet över hela världen, vilket ger möjlighet till internationella utbyten. Som anställd doktorand får du en avtalsenlig lön, du får träna fritt i våra moderna friskvårdsanläggningar och du får ersättning för läkarvård.

Behörighetskrav för utbildning på forskarnivå

För att delta i urvalet till en doktorandplats måste du styrka både det grundläggande (A) och det särskilda (B) behörighetskravet innan ansökningsperioden stänger.

Det är ditt ansvar som sökande att styrka din behörighet genom att följa instruktionerna på webbsidan Behörighet till utbildning på forskarnivå.

A) Grundläggande behörighetskrav

Du uppfyller det grundläggande behörighetskravet för utbildning på forskarnivå om du:

1. Har avlagt en examen på avancerad nivå (magister- eller masterexamen), eller
2. Har fullgjort kursfordringar om minst 240 högskolepoäng, varav minst 60 högskolepoäng på avancerad nivå, eller
3. Har på annat sätt förvärvat i huvudsak motsvarande kunskaper.*

Följ instruktionerna på webbsidan Behörighet till utbildning på forskarnivå.

*Om du anser dig ha motsvarande kunskaper ska du följa instruktionerna på webbsidan Bedömning av motsvarande kunskaper för grundläggande behörighet till utbildning på forskarnivå.

B) Särskilt behörighetskrav

Du uppfyller det särskilda behörighetskravet för utbildning på forskarnivå om du:

• Intygar kunskaper i engelska (motsvarande Engelska B/Engelska 6 vid gymnasiet med godkänt betyg).

Följ instruktionerna på webbsidan English language requirements for doctoral education.

Kontroll av dokument: Karolinska Institutet gör kontroll av dokumenten för att upptäcka förfalskningar. Karolinska Institutet förbehåller sig rätten att återkalla antagningsbeslut om förfalskningar eller oriktigheter påvisas. Inlämnande av falska handlingar är ett brott mot svensk lag och anses vara grund för rättsliga åtgärder.

Färdigheter och personliga egenskaper

Vi söker en kreativ och självgående kandidat som är intresserad av att utveckla nya metoder inom livsvetenskap. Kandidaten bör vara bekväm med att arbeta både i ett laboratorium och använda beräkningsverktyg för att analysera data och dra slutsatser. Du bör vara välorganiserad, ha utmärkta kommunikationsfärdigheter och kunna arbeta effektivt inom ett tvärvetenskapligt team.

Utöver ovan nämnda krav för rollen:

• En magisterexamen i Ingenjörsvetenskap, Nanoteknik, fysik, kemi eller ett relaterat område (eller motsvarande vid start av tjänsten)
• Erfarenhet av arbete i ett laboratorium
• Erfarenhet av programmering i Python eller ett liknande språk
• Flytande engelska (skriftligt och muntligt)
• Starka interpersonella färdigheter och positiva referenser från tidigare forskningsmiljöer

Meriterande för rollen:

• Erfarenhet av design av DNA nanostrukturer
• Erfarenhet av simulera biomolekyler (föredragsvis DNA / RNA)
• Erfarenhet av tekniker och metoder från fysik

Villkor

Doktorandplatsen innebär en anställning som doktorand under maximalt 4 år på heltid.

Ansökan

Du söker doktorandplatsen i rekryteringsverktyget Varbi. Använd knappen uppe till höger och följ anvisningarna. Vi ser gärna att din ansökan är skriven på engelska, men det går också bra att ansöka på svenska.

Din ansökan ska innehålla följande dokument:

• Ett personligt brev och curriculum vitae
• Eventuella examensarbeten och publikationer
• Andra dokument som styrker de ovan efterfrågade färdigheter och egenskaper
• Dokument som styrker det grundläggande behörighetskravet (se A ovan)
• Dokument som styrker det särskilda behörighetskravet (se B ovan)

Urval

Urval bland behöriga sökande görs med hänsyn till deras förmåga att tillgodogöra sig forskarutbildning. En samlad bedömning av de sökandes meriter och lämplighet kommer att göras.

Följande bedömningsgrunder tillämpas vid Karolinska Institutet:

• Dokumenterade ämneskunskaper av betydelse för forskningsområdet
• Analytisk skicklighet
• Övriga dokumenterade kunskaper/erfarenheter som kan ha betydelse för aktuell forskarutbildning  

Alla sökanden kommer att få information när rekryteringen är slutförd.

https://bensonlab.se/

Vill du göra skillnad - och bidra till en bättre hälsa för alla? Sök till Karolinska Institutet