Doktorandplats inom beräkningspatologi - Under tillsättning eller tillsatt, ej sökbar

Vill du bidra till medicinsk forskning av toppkvalitet?

Att vara doktorand innebär att vara antagen till en utbildning på forskarnivå (forskarutbildning) där man följer en individuell studieplan. En doktorand ägnar sig åt ett forskningsprojekt under handledning, kompletterat med kurser och andra lärandeaktiviteter. För en doktorsexamen krävs motsvarande fyra års utbildning på forskarnivå på heltid.

Institutionen för medicinsk epidemiologi och biostatistik bedriver forskning inom epidemiologi och biostatistik inom ett brett spektrum av områden inom biomedicinsk vetenskap. Institutionen är bland de största inom sitt område i Europa och har särskilt starka forskningsprofiler inom psykiatrisk, cancer-, reproduktiv, pediatrisk, farmakologisk, genetisk och geriatrisk epidemiologi, ätstörningar, precisionsmedicin, och biostatistik.

En del av framgången för institutionen beror på vår samarbetsanda, där en stor bidragande faktor är att forskare vid institutionen delar och samfinansierar gemensamma resurser (som t.ex. IT och en tillämpad biostatistikgrupp). Institutionen ligger på campus Solna. Mer information finns på http://ki.se/meb.

Forskargruppen

Detta doktorandprogram är förankrat inom prostatacancerforskningsmiljön vid Institutionen för medicinsk epidemiologi och biostatistik (MEB) och forskargruppen för kolorektalkirurgi vid Institutionen för molekylär medicin och kirurgi (MMK). Doktoranden kommer att vara anställd vid MEB, men förväntas arbeta aktivt i båda forskargrupperna i detta samarbetsprojekt. De involverade forskargrupperna har en gedigen meritlista när det gäller att utföra innovativ och effektfull forskning, som spänner över högkvalitativa datakällor, innovativa kliniska prövningar, banbrytande genomik, såväl som maskininlärning och artificiell intelligens (AI) för att främja diagnostik av prostatacancer och kolorektalcancer och behandling. Vi erbjuder en tvärvetenskaplig och levande forskningsmiljö i den internationella framkanten av att utveckla och implementera precisionsmedicinska strategier för att förbättra diagnostik och behandling.

Doktorandprojektet och doktorandens uppgifter

Arbetet syftar till att förbättra cancervården, med fokus på kolorektalcancer, genom att utveckla AI-tekniker för digital patologidata. Kolorektalcancer är den näst vanligaste orsaken till cancerrelaterad dödlighet i världen. Sjukdomen ledde till över 900 000 dödsfall 2020, och den förväntas vara en betydande global börda i framtiden. Hantering av sjukdomen drar nytta av forskning på flera vinklar, inklusive förbättrad förebyggande, diagnostik, behandling och etiologisk förståelse av dess orsaker.

Forskning om att använda AI som ett medicinskt verktyg blir framträdande i många sammanhang, inklusive upptäckt, diagnostik, prognostik och behandling av cancer. Arbetet i detta projekt syftar till att utveckla AI och bildanalysalgoritmer för att analysera högupplösta digitala bilder av vävnadsprover, tillsammans med genomikdata, för att förbättra histopatologisk diagnostik och prognostik för kolorektalcancer. Dessutom omfattar projektet utveckling av bildbehandlings- och AI-metoder med bredare tillämpbarhet i andra sjukdomstyper och beräkningspatologiapplikationer, såsom vävnadsdetektering och algoritmer för uppskattning av osäkerhet.

Doktoranden förväntas bygga en djupgående förståelse för den senaste AI- och bildanalysmetoden och att absorbera en nödvändig nivå av medicinsk och histopatologisk kunskap samtidigt som han arbetar som en del av ett tvärvetenskapligt team av forskare och kliniker. Tjänsten som doktorand innebär att ta en aktiv roll i att driva egna forskningsprojekt, med ledning av handledarteamet, och i att förbereda vetenskapliga forskningsartiklar för publicering.

Vad erbjuder vi? 

En kreativ och inspirerande miljö fylld av kompetens och nyfikenhet. Karolinska Institutet är ett av världens ledande medicinska universitet. Vår vision är att driva utvecklingen av kunskap om livet och verka för en bättre hälsa för alla. Här bedriver vi framgångsrik medicinsk forskning och har det största utbudet av medicinska utbildningar i Sverige. Som doktorand erbjuds du ett individuellt forskningsprojekt, en välutbildad handledare, ett stort utbud av valbara kurser och möjligheten att arbeta i en framgångsrik forskargrupp. Karolinska Institutet har samarbeten med framstående universitet över hela världen, vilket ger möjlighet till internationella utbyten. Som anställd doktorand får du en avtalsenlig lön. Du får också träna fritt i våra moderna friskvårdsanläggningar och får ersättning för läkarvård.

Behörighetskrav för utbildning på forskarnivå

För att delta i urvalet till en doktorandplats måste du styrka både det grundläggande (A) och det särskilda (B) behörighetskravet innan ansökningsperioden stänger.

Det är ditt ansvar som sökande att styrka din behörighet genom att följa instruktionerna på webbsidan Behörighet till utbildning på forskarnivå.

A) Grundläggande behörighetskrav

Du uppfyller det grundläggande behörighetskravet för utbildning på forskarnivå om du:

1. har avlagt en examen på avancerad nivå (magister- eller masterexamen), eller
2. har fullgjort kursfordringar om minst 240 högskolepoäng, varav minst 60 högskolepoäng på avancerad nivå, eller
3. har på annat sätt förvärvat i huvudsak motsvarande kunskaper.*

Följ instruktionerna på webbsidan Behörighet till utbildning på forskarnivå.

*Om du anser dig ha motsvarande kunskaper ska du följa instruktionerna på webbsidan Bedömning av motsvarande kunskaper för grundläggande behörighet till utbildning på forskarnivå.

B) Särskilt behörighetskrav

Du uppfyller det särskilda behörighetskravet för utbildning på forskarnivå om du:

- Intygar kunskaper i engelska (motsvarande Engelska B/Engelska 6 vid gymnasiet med godkänt betyg).

Följ instruktionerna på webbsidan English language requirements for doctoral education.

Kontroll av dokument Karolinska Institutet gör kontroll av dokumenten för att upptäcka förfalskningar. Karolinska Institutet förbehåller sig rätten att återkalla antagningsbeslut om förfalskningar eller oriktigheter påvisas. Inlämnande av falska handlingar är ett brott mot svensk lag och anses vara grund för rättsliga åtgärder.

Färdigheter och personliga egenskaper

Den sökande förväntas ha följande kompetens och erfarenhet:

• Starka problemlösnings- och matematiska färdigheter samt ett intresse och förmåga att på djupet förstå de algoritmiska grunderna för AI och bildanalysmetoder.
• Starka programmeringskunskaper, särskilt i Python, och erfarenhet av mjukvaruutveckling (t.ex. versionskontroll och verktyg för beroendehantering).
• Flytande engelska i tal och skrift.
  
  

Följande färdigheter och erfarenhet anses meriterande:

• Erfarenhet av att analysera digital patologidata och förtrogenhet med whole slide image bildformat och verktyg (t.ex. OpenSlide, Bioformats, QuPath, Cytomine).
• Erfarenhet av AI och bildanalysramverk t.ex. PyTorch, TensorFlow, OpenCV.
• Kunskaper inom andra programmeringsspråk som används i bildanalys och biostatistik (t.ex. MATLAB, R).
• Expertis inom datahantering, databaser och register, särskilt med kliniska data.
• Erfarenhet av att bedriva cancerforskning i en tvärvetenskaplig miljö och kommunicera med kliniker och forskare.
  
  

Vi lägger stor vikt vid personliga egenskaper i denna rekrytering. Den sökande ska vara mycket kollegial och kunna arbeta väl i ett tvärvetenskapligt team samt ha förmåga att arbeta självständigt. Vidare bör den sökande ha exceptionella organisatoriska färdigheter och veta hur man framgångsrikt multitaskar. Den sökande ska ha god analytisk förmåga, besitta nyfikenhet och kreativitet samt ha förmåga att tillsammans med handledaren ta ansvar för forskningsprojekt.

Villkor

Doktorandplatsen innebär en anställning som doktorand under maximalt 4 år på heltid.

Ansökan

Du söker doktorandplatsen i rekryteringsverktyget Varbi. Använd knappen uppe till höger och följ anvisningarna. Vi ser gärna att din ansökan är skriven på engelska, men det går också bra att ansöka på svenska.

Din ansökan ska innehålla dessa dokument:

- Ett personligt brev och curriculum vitae 
- Eventuella examensarbeten och publikationer 
- Andra dokument som styrker de ovan efterfrågade färdigheter och egenskaper 
- Dokument som styrker det grundläggande behörighetskravet (se A ovan)
- Dokument som styrker det särskilda behörighetskravet (se B ovan)

Urval

Urval bland behöriga sökande görs med hänsyn till deras förmåga att tillgodogöra sig forskarutbildning. En samlad bedömning av de sökandes meriter och lämplighet kommer att göras.

Följande bedömningsgrunder tillämpas vid Karolinska Institutet:

- Dokumenterade ämneskunskaper av betydelse för forskningsområdet
- Analytisk skicklighet
- Övriga dokumenterade kunskaper/erfarenheter som kan ha betydelse för aktuell forskarutbildning  

Alla sökanden kommer att få information när rekryteringen är slutförd.

Vill du göra skillnad - och bidra till en bättre hälsa för alla? Sök till Karolinska Institutet