Doktorandplats inom Epigenetik för neuroinflammation och neurodegeneration - Under tillsättning eller tillsatt, ej sökbar

Vill du bidra till medicinsk forskning av toppkvalitet?

Att vara doktorand innebär att vara antagen till en utbildning på forskarnivå (forskarutbildning) där man följer en individuell studieplan. En doktorand ägnar sig åt ett forskningsprojekt under handledning, kompletterat med kurser och andra lärandeaktiviteter. För en doktorsexamen krävs motsvarande fyra års utbildning på forskarnivå på heltid.

Forskargruppen

Nu finns en möjlighet att ingå i professor Maja Jagodic dynamiska och samarbetsvilliga grupp under handledning av Dr Lara Kular vid Institutionen för klinisk neurovetenskap. Du erbjuds möjligheten att bidra till interaktiv forskning som drivs av relevanta kliniska frågor, där djup molekylär förståelse av de mekanismer som ligger till grund för multipel skleros (MS) kombineras med några av de mest konkurrenskraftiga kliniska materialen i hela världen. Du kommer att dra nytta av en mycket samarbetsvillig, engagerad och internationell forskningsmiljö som är engagerad i att utforska innovativa translationella idéer inom precisionsmedicin, där du kommer att ha möjlighet att bedriva forskning på högsta internationella nivå inom området.

Doktorandprojektet och doktorandens uppgifter

MS är en ledande orsak till progressivt funktionshinder hos unga vuxna och en mycket heterogen neurodegenerativ sjukdom när det gäller klinisk presentation och behandlingssvar. Vi tror att studier av epigenetiska mekanismer kommer att underlätta för en bättre förståelse och hantering av sjukdomens utveckling och progression. Du kommer att bidra till vårt arbete med att avslöja epigenetiska mekanismer som ligger till grund för neuroinflammation och neurodegeneration vid MS med hjälp av både storskaliga omiska metoder i unika kliniska prover i kombination med molekylära in vivo- och in vitro-funktionsexperiment. Mer specifikt kommer du att tillämpa avancerad teknik för nästa generations sekvensering (NGS) för multikomiska undersökningar i sällsynta kliniska prover med låg input, med fokus på epigenetik, särskilt DNA-metylering, och för utforskning av biomarkörer.

Dessutom kommer du i rollen som doktorand genomföra funktionella undersökningar i olika immun- och nervcellmodeller (cellinjer, ex vivo, organoid) med hjälp av traditionella och nya verktyg, t.ex. CRISPR/dCas9-baserad epigenomredigering. Du kommer att utbildas och aktivt delta i alla delar av det vetenskapliga arbetet, inklusive utformning och utveckling av molekylära och cellulära analyser, extraktion av nukleinsyror från biologiska prover från människor, uppbyggnad av bibliotek, datatolkning (databehandling och analys är valfritt) samt redigering av manuskript och presentation av forskningsresultat vid internationella konferenser. Vi förväntar oss att du kommer samverka med många interna och externa medarbetare och bidra till att enheten fungerar effektivt.

Vad erbjuder vi? 

En kreativ och inspirerande miljö fylld av kompetens och nyfikenhet. Karolinska Institutet är ett av världens ledande medicinska universitet. Vår vision är att driva utvecklingen av kunskap om livet och verka för en bättre hälsa för alla. Här bedriver vi framgångsrik medicinsk forskning och har det största utbudet av medicinska utbildningar i Sverige. Som doktorand erbjuds du ett individuellt forskningsprojekt, en välutbildad handledare, ett stort utbud av valbara kurser och möjligheten att arbeta i en framgångsrik forskargrupp. Karolinska Institutet har samarbeten med framstående universitet över hela världen, vilket ger möjlighet till internationella utbyten. Som anställd doktorand får du en avtalsenlig lön. Du får också träna fritt i våra moderna friskvårdsanläggningar och får ersättning för läkarvård.

Behörighetskrav för utbildning på forskarnivå

För att delta i urvalet till en doktorandplats måste du styrka både det grundläggande (A) och det särskilda (B) behörighetskravet innan ansökningsperioden stänger.

Det är ditt ansvar som sökande att styrka din behörighet genom att följa instruktionerna på webbsidan Behörighet till utbildning på forskarnivå.

A) Grundläggande behörighetskrav

Du uppfyller det grundläggande behörighetskravet för utbildning på forskarnivå om du:

1. har avlagt en examen på avancerad nivå (magister- eller masterexamen), eller
2. har fullgjort kursfordringar om minst 240 högskolepoäng, varav minst 60 högskolepoäng på avancerad nivå, eller
3. har på annat sätt förvärvat i huvudsak motsvarande kunskaper.*

Följ instruktionerna på webbsidan Behörighet till utbildning på forskarnivå.

*Om du anser dig ha motsvarande kunskaper ska du följa instruktionerna på webbsidan Bedömning av motsvarande kunskaper för grundläggande behörighet till utbildning på forskarnivå.

B) Särskilt behörighetskrav

Du uppfyller det särskilda behörighetskravet för utbildning på forskarnivå om du:

- Intygar kunskaper i engelska (motsvarande Engelska B/Engelska 6 vid gymnasiet med godkänt betyg).

Följ instruktionerna på webbsidan English language requirements for doctoral education.

Kontroll av dokument Karolinska Institutet gör kontroll av dokumenten för att upptäcka förfalskningar. Karolinska Institutet förbehåller sig rätten att återkalla antagningsbeslut om förfalskningar eller oriktigheter påvisas. Inlämnande av falska handlingar är ett brott mot svensk lag och anses vara grund för rättsliga åtgärder.

Färdigheter och personliga egenskaper

Krav för tjänsten:

• Master i biovetenskap.
• Utmärkta dokumenterade praktiska färdigheter i molekylärbiologiska tekniker (särskilt bearbetning och analys av nukleinsyror).
• Dokumenterad erfarenhet av NGS-baserade metoder (företrädesvis i material med låg input) för single- och multi-omics, t.ex. separat eller kombinerad DNA-metylering och tillgänglighet, analys av genuttryck (RNA-seq) och metoder för att fånga kromosomkonformation (Hi-C).
• Erfarenhet av och/eller starkt intresse för metodutveckling.
• Erfarenhet av in vitro cellodling (mänskliga cellinjer), vävnadskultur och verktyg för epigenomredigering (CRISPR/dCas9-system).
• Kunskap om mekanismer för genreglering, särskilt epigenetik, vid komplexa sjukdomar hos människor.
• Goda kunskaper i engelska i tal och skrift.
• Professionell attityd, förmåga att anpassa sig till en dynamisk arbetsmiljö och att samarbeta med tvärvetenskapliga forskargrupper.
• God kommunikations-, dokumentations- och rapporteringsförmåga.

Följande ytterligare färdigheter skulle bedömas positivt:

• Praktisk och teoretisk kunskap om neuroinflammatoriska och neurodegenerativa sjukdomar.
• Erfarenhet av automatiserade system för vätskehantering (t.ex. TECAN, MANTIS).
• Praktisk kunskap om immunfärgning och fluorescensmikroskopi.
• Grundläggande kunskaper i bioinformatik, inklusive kännedom om olika pipelines (t.ex. nf-core, MultiQC) och paket, särskilt för analys av DNA-metylering (R studio och Terminal).

Villkor

Doktorandplatsen innebär en anställning som doktorand under maximalt 4 år på heltid.

Ansökan

Du söker doktorandplatsen i rekryteringsverktyget Varbi. Använd knappen uppe till höger och följ anvisningarna. Vi ser gärna att din ansökan är skriven på engelska, men det går också bra att ansöka på svenska.

Din ansökan ska innehålla dessa dokument:

- Ett personligt brev och curriculum vitae 
- Eventuella examensarbeten och publikationer 
- Andra dokument som styrker de ovan efterfrågade färdigheter och egenskaper 
- Dokument som styrker det grundläggande behörighetskravet (se A ovan)
- Dokument som styrker det särskilda behörighetskravet (se B ovan)

Urval

Urval bland behöriga sökande görs med hänsyn till deras förmåga att tillgodogöra sig forskarutbildning. En samlad bedömning av de sökandes meriter och lämplighet kommer att göras.

Följande bedömningsgrunder tillämpas vid Karolinska Institutet:

- Dokumenterade ämneskunskaper av betydelse för forskningsområdet
- Analytisk skicklighet
- Övriga dokumenterade kunskaper/erfarenheter som kan ha betydelse för aktuell forskarutbildning  

Alla sökanden kommer att få information när rekryteringen är slutförd.

Läs mer om Institutionen för klinisk neurovetenskap här
Läs mer om forskargruppen du kommer ingå i här

Vill du göra skillnad - och bidra till en bättre hälsa för alla? Sök till Karolinska Institutet!