Doktorandplats i RNA-biologi och transkriptomik - Under tillsättning eller tillsatt, ej sökbar

Vill du bidra till medicinsk forskning av toppkvalitet?

Att vara doktorand innebär att vara antagen till en utbildning på forskarnivå (forskarutbildning) där man följer en individuell studieplan. En doktorand ägnar sig åt ett forskningsprojekt under handledning, kompletterat med kurser och andra lärandeaktiviteter. För en doktorsexamen krävs motsvarande fyra års utbildning på forskarnivå på heltid.

Forskargruppen

Kutter-labbet utforskar molekylära mekanismer genom vilka kodande och icke-kodande RNA reglerar arternas utveckling, organutveckling och celldifferentiering i friska och sjuka celler. Rollerna för regulatoriska RNA:n undersöks genom- och transkriptomomfattande genom att använda en kombination av nästa generations sekvenseringsteknologier och metoder för genetisk screening med hög genomströmning, utveckling av beräkningsmetoder, tillsammans med komplettering av biokemiska, molekylära och cellbiologiska metoder (Geng et al. Genome) Research 2022, Søndergaard et al. Gut, 2022, Gao et al. Genome Research 2022). Gruppen använder en integrerande och samarbetsstrategi och arbetar nära med experimentella och beräkningsgrupper vid MTC, Science for Life Laboratory (SciLifeLab) och andra lokala och internationella forskargrupper.

För mer information om laboratoriets arbete, besök https://www.scilifelab.se/researchers/claudia-kutter/.

Doktorandprojektet och doktorandens uppgifter

Människokroppen består av hundratals mycket specialiserade och morfologiskt olika celler, men praktiskt taget varje cell i kroppen innehåller samma genetiska information. För att utöva cellspecifika funktioner begränsar högtrohetsmekanismer uttrycket och bearbetningen till endast en viss uppsättning gener och transkript. Onormalt cellbeteende som ses i många dödliga mänskliga sjukdomar, såsom cancer, är ofta en konsekvens av avvikande transkriptbildning. Forskningsprogrammet för denna position fokuserar på regleringen av kodande och icke-kodande RNA under celldifferentiering och sjukdomsprogression, med ett särskilt intresse för involveringen av RNA-bindande proteiner under transkriptbehandling och hur de synergerar med andra faktorer i däggdjurssystem genom att använda olika celler linjer, mus och mänskliga vävnader som modellsystem.

Som medlem av Kutter-labbet kommer doktoranden att tillämpa, optimera och integrera nya transkriptom- och genomomfattande tillvägagångssätt (baserade på bulk- och encells-RNA-sekvensering och epigenomprofileringsdata) för att studera bearbetningen och regleringen av icke-kodande RNA:er vid bearbetning i leverutveckling och sjukdomar, utföra valideringsexperiment som involverar biokemiska och molekylärbiologiska verktyg och delta i teamets allmänna uppgifter. Befattningshavaren kommer att ta en stark ledning i projektdesign och ledning samt datagenerering, analyser och tolkning, delta i teamets allmänna uppgifter och samarbeta med andra teammedlemmar. Doktoranden förväntas även att rapportera de vetenskapliga resultaten genom att skriva vetenskapliga artiklar, delta i vetenskapliga möten och effektivt kommunicera med kollegor. Förmågan att arbeta i en mycket tvärvetenskaplig och internationell miljö, och att engagera sig i kontinuerlig professionell utveckling är ett måste.

Huvudhandledare är Dr Claudia Kutter (KI-MTC, SciLifeLab). Kandidaten kommer att samhandles av Prof. Dr. Jorge Ruas (KI-FyFa) och Dr. Oscar Bedoya Reina (KI-MTC).

Vad erbjuder vi? 

En kreativ och inspirerande miljö fylld av kompetens och nyfikenhet. Karolinska Institutet är ett av världens ledande medicinska universitet. Vår vision är att driva utvecklingen av kunskap om livet och verka för en bättre hälsa för alla. Här bedriver vi framgångsrik medicinsk forskning och har det största utbudet av medicinska utbildningar i Sverige. Som doktorand erbjuds du ett individuellt forskningsprojekt, en välutbildad handledare, ett stort utbud av valbara kurser och möjligheten att arbeta i en framgångsrik forskargrupp. Karolinska Institutet har samarbeten med framstående universitet över hela världen, vilket ger möjlighet till internationella utbyten. Som anställd doktorand får du en avtalsenlig lön. Du får också träna fritt i våra moderna friskvårdsanläggningar och får ersättning för läkarvård.

Behörighetskrav för utbildning på forskarnivå

För att delta i urvalet till en doktorandplats måste du styrka både det grundläggande (A) och det särskilda (B) behörighetskravet innan ansökningsperioden stänger.

Det är ditt ansvar som sökande att styrka din behörighet genom att följa instruktionerna på webbsidan Behörighet till utbildning på forskarnivå.

A) Grundläggande behörighetskrav

Du uppfyller det grundläggande behörighetskravet för utbildning på forskarnivå om du:

1. har avlagt en examen på avancerad nivå (magister- eller masterexamen), eller
2. har fullgjort kursfordringar om minst 240 högskolepoäng, varav minst 60 högskolepoäng på avancerad nivå, eller
3. har på annat sätt förvärvat i huvudsak motsvarande kunskaper.*

Följ instruktionerna på webbsidan Behörighet till utbildning på forskarnivå.

*Om du anser dig ha motsvarande kunskaper ska du följa instruktionerna på webbsidan Bedömning av motsvarande kunskaper för grundläggande behörighet till utbildning på forskarnivå.

B) Särskilt behörighetskrav

Du uppfyller det särskilda behörighetskravet för utbildning på forskarnivå om du:

- Intygar kunskaper i engelska (motsvarande Engelska B/Engelska 6 vid gymnasiet med godkänt betyg).

Följ instruktionerna på webbsidan English language requirements for doctoral education.

Kontroll av dokument Karolinska Institutet gör kontroll av dokumenten för att upptäcka förfalskningar. Karolinska Institutet förbehåller sig rätten att återkalla antagningsbeslut om förfalskningar eller oriktigheter påvisas. Inlämnande av falska handlingar är ett brott mot svensk lag och anses vara grund för rättsliga åtgärder.

Färdigheter och personliga egenskaper

Vi söker entusiastiska och mycket motiverade kandidater som har en examen inom biomedicin, bioinformatik, genomik, transkriptomik, molekylärbiologi, genetik och/eller biokemi. Beprövade erfarenheter av däggdjurs-RNA-biologi, genreglering, transkriptomstudier; FISH, enmolekylavbildning och mikroskopi; FRET, biokemiska och molekylära analyser; tekniker för odling av däggdjursvävnad och cellulär/metabolisk profilering; CRISPR/Cas-systemet är viktiga. Förkunskaper inom bioinformatik och R-programmering för statistisk beräkning och grafik är meriterande. Ett starkt intresse för tvärvetenskaplig teknikutveckling och nytänkande och kreativt tänkande är väsentliga. Sökande som vill integrera beräknings- och experimentbiologiska tillvägagångssätt uppmuntras särskilt att ansöka. Den idealiska kandidaten bör vara samarbetsvillig, vetenskapligt äventyrlig, nyfikenhetsdriven och bör föra in oberoende och originella idéer i projektet. Alla tidigare uppgifter om oberoende forskning såväl som produktiva interaktioner inom en tvärvetenskaplig teammiljö (t.ex. första- och/eller medförfattarpublikationer i högprofilerade tidskrifter) är fördelaktiga. Eftersom den sökande kommer att arbeta i en tvärvetenskaplig miljö är förmågan att samarbeta med andra forskare och goda kommunikationsförmåga (kunskaper i tal och skrift engelska) viktigt.

Villkor

Doktorandplatsen innebär en anställning som doktorand under maximalt 4 år på heltid.

Ansökan

Du söker doktorandplatsen i rekryteringsverktyget Varbi. Använd knappen uppe till höger och följ anvisningarna. Vi ser gärna att din ansökan är skriven på engelska, men det går också bra att ansöka på svenska.

Din ansökan ska innehålla dessa dokument:

- Ett personligt brev och curriculum vitae 
- Eventuella examensarbeten och publikationer 
- Andra dokument som styrker de ovan efterfrågade färdigheter och egenskaper 
- Dokument som styrker det grundläggande behörighetskravet (se A ovan)
- Dokument som styrker det särskilda behörighetskravet (se B ovan)

Urval

Urval bland behöriga sökande görs med hänsyn till deras förmåga att tillgodogöra sig forskarutbildning. En samlad bedömning av de sökandes meriter och lämplighet kommer att göras.

Följande bedömningsgrunder tillämpas vid Karolinska Institutet:

- Dokumenterade ämneskunskaper av betydelse för forskningsområdet
- Analytisk skicklighet
- Övriga dokumenterade kunskaper/erfarenheter som kan ha betydelse för aktuell forskarutbildning  

Alla sökanden kommer att få information när rekryteringen är slutförd.

https://ki.se/en/mtc/kutter-group-regulatory-transcriptions 
https://www.scilifelab.se/researchers/claudia-kutter/

Vill du göra skillnad - och bidra till en bättre hälsa för alla? Sök till Karolinska Institutet