Doktorandplats inom digital prostatapatologi - Under tillsättning eller tillsatt, ej sökbar

Vill du bidra till att förbättra människors hälsa?

Att vara doktorand innebär att vara antagen till en utbildning på forskarnivå (forskarutbildning) där man följer en individuell studieplan. En doktorand ägnar sig åt ett forskningsprojekt under handledning, kompletterat med kurser och andra lärandeaktiviteter. För en doktorsexamen krävs motsvarande fyra års utbildning på forskarnivå på heltid.

Forskargruppen

Med 1,1 miljoner nya diagnoser varje år är prostatacancer den vanligaste cancerformen hos män i utvecklade länder. Prostatacancergruppen vid MEB är en mycket tvärvetenskaplig och levande forskargrupp i den internationella framkanten av att utveckla och implementera precisionsmedicinska strategier för att förbättra diagnostik och behandling av prostatacancer. Forskningen spänner över världsledande datakällor, innovativa kliniska prövningar, banbrytande genomik, maskininlärning och artificiell intelligens.

Doktorandprojektet och doktorandens uppgifter

Arbetet syftar till prostatacancervävnadsanalys baserad på digital patologidata. Biopsi Gleason graderingssystem är den viktigaste prognostiska markören för prostatacancer men lider av betydande inter-observatörsvariabilitet, vilket begränsar dess användbarhet för enskilda patienter. Gleason-graden bestäms av patologer baserat på tumörens mikroskopiska tillväxtmönster som är synliga i vävnadsprover och ligger till grund för behandlingsbeslut. Vi söker nu en doktorand med intresse för digital patologi för att utföra analyser på digitala prostatapatologiglas.

Vad erbjuder vi? 

En kreativ och inspirerande miljö fylld av kompetens och nyfikenhet. Karolinska Institutet är ett av världens ledande medicinska universitet. Vår vision är att driva utvecklingen av kunskap om livet och verka för en bättre hälsa för alla. Här bedriver vi framgångsrik medicinsk forskning och har det största utbudet av medicinska utbildningar i Sverige. Som doktorand erbjuds du ett individuellt forskningsprojekt, en välutbildad handledare, ett stort utbud av valbara kurser och möjligheten att arbeta i en framgångsrik forskargrupp. Karolinska Institutet har samarbeten med framstående universitet över hela världen, vilket ger möjlighet till internationella utbyten. Som anställd doktorand får du en avtalsenlig lön. Du får också träna fritt i våra moderna friskvårdsanläggningar och får ersättning för läkarvård.

Behörighetskrav för utbildning på forskarnivå

För att delta i urvalet till en doktorandplats måste du styrka både det grundläggande (A) och det särskilda (B) behörighetskravet innan ansökningsperioden stänger.

Det är ditt ansvar som sökande att styrka din behörighet genom att följa instruktionerna på webbsidan Behörighet till utbildning på forskarnivå.

A) Grundläggande behörighetskrav

Du uppfyller det grundläggande behörighetskravet för utbildning på forskarnivå om du:

1. har avlagt en examen på avancerad nivå (magister- eller masterexamen), eller
2. har fullgjort kursfordringar om minst 240 högskolepoäng, varav minst 60 högskolepoäng på avancerad nivå, eller
3. har på annat sätt förvärvat i huvudsak motsvarande kunskaper.*

Följ instruktionerna på webbsidan Behörighet till utbildning på forskarnivå.

*Om du anser dig ha motsvarande kunskaper ska du följa instruktionerna på webbsidan Bedömning av motsvarande kunskaper för grundläggande behörighet till utbildning på forskarnivå.

B) Särskilt behörighetskrav

Du uppfyller det särskilda behörighetskravet för utbildning på forskarnivå om du:

- Intygar kunskaper i engelska (motsvarande Engelska B/Engelska 6 vid gymnasiet med godkänt betyg).

Följ instruktionerna på webbsidan English language requirements for doctoral education.

Kontroll av dokument Karolinska Institutet gör kontroll av dokumenten för att upptäcka förfalskningar. Karolinska Institutet förbehåller sig rätten att återkalla antagningsbeslut om förfalskningar eller oriktigheter påvisas. Inlämnande av falska handlingar är ett brott mot svensk lag och anses vara grund för rättsliga åtgärder.

Färdigheter

Den sökande bör ha medicinska kunskaper och ha erfarenhet av bildanalys, utveckling av deep learning modeller samt ha ett stort intresse för prostatapatologi. Erfarenhet från tillämpningar av maskininlärningsmetoder och effektiva konvolutionella neurala nätverklösningar inom medicin och/eller epidemiologi anses också som starka meriter, tillsammans med erfarenhet från tvärvetenskaplig forskning i en cancerforskningsmiljö.

Starka programmeringskunskaper (t.ex. i Python, R eller MATLAB) är ett måste, och erfarenhet av API och mjukvaruutveckling (inklusive t.ex. versionskontroll och verktyg för beroendehantering) är centralt. Kännedom om ramverk för maskininlärning och bildanalys (t.ex. TensorFlow, PyTorch, Keras, Scikit-learn, OpenCV), Whole Slide Image bildfilformat och verktyg (t.ex. OpenSlide, Bioformats, QuPath, Cytomine), databaser och högpresterande kluster-/molnberäkning anses vara starka förtjänster. Erfarenhet av bildanalys från olika typer av Whole Slide Image skannrar, inklusive de från Aperio, Hamamatsu och Philips, är meriterande. Den kandidat som har forskningserfarenhet av digital patologi och som har erfarenhet från utveckling av prediktionsmodeller för traumapatientvård kommer att prioriteras. Flytande engelska krävs.

Personliga egenskaper

Den sökande ska vara mycket kollegial och kunna arbeta väl i ett tvärvetenskapligt team samt ha förmåga att arbeta självständigt. Vidare bör den sökande besitta exceptionella organisatoriska färdigheter, veta hur man framgångsrikt multitaskar och bör kunna beskriva tidigare exempel på att ha utvecklat strukturerade metoder för att lösa oförutsedda och komplexa problem.

Den sökande ska ha god analytisk förmåga, besitta nyfikenhet och kreativitet samt ha förmåga att tillsammans med handledaren ta ansvar för forskningsprojekt.

Villkor

Doktorandplatsen innebär en anställning som doktorand under maximalt 4 år på heltid.

Ansökan

Du söker doktorandplatsen i rekryteringsverktyget Varbi. Använd knappen uppe till höger och följ anvisningarna. Vi ser gärna att din ansökan är skriven på engelska, men det går också bra att ansöka på svenska.

Din ansökan ska innehålla dessa dokument:

- Ett personligt brev och curriculum vitae 
- Eventuella examensarbeten och publikationer 
- Andra dokument som styrker de ovan efterfrågade färdigheter och egenskaper 
- Dokument som styrker det grundläggande behörighetskravet (se A ovan)
- Dokument som styrker det särskilda behörighetskravet (se B ovan)

Urval

Urval bland behöriga sökande görs med hänsyn till deras förmåga att tillgodogöra sig forskarutbildning. En samlad bedömning av de sökandes meriter och lämplighet kommer att göras.

Följande bedömningsgrunder tillämpas vid Karolinska Institutet:

- Dokumenterade ämneskunskaper av betydelse för forskningsområdet
- Analytisk skicklighet
- Övriga dokumenterade kunskaper/erfarenheter som kan ha betydelse för aktuell forskarutbildning  

Alla sökanden kommer att få information när rekryteringen är slutförd.

Vill du göra skillnad - och bidra till en bättre hälsa för alla? Sök till Karolinska Institutet