Doktorandplats i cancerberäkningsbiologi - Under tillsättning eller tillsatt, ej sökbar

Vill du bidra till medicinsk forskning av toppkvalitet?

Att vara doktorand innebär att vara antagen till en utbildning på forskarnivå (forskarutbildning) där man följer en individuell studieplan. En doktorand ägnar sig åt ett forskningsprojekt under handledning, kompletterat med kurser och andra lärandeaktiviteter. För en doktorsexamen krävs motsvarande fyra års utbildning på forskarnivå på heltid.

Forskargruppen

Hausser labb forskar om kvantitativa principer inom tumörbiologi. Vi gör det längs två forskningslinjer:

(1) Inom en tumör uttrycker enstaka cancerceller olika gener. Dessa skillnader underlättar resistens mot anti-cancerterapi eftersom en given terapi kan misslyckas med att eliminera mångfalden av cancerceller. Vi är intresserade av att kartlägga de evolutionära gränserna för denna mångfald och att utforska hur man förklarar dessa gränser för att behandla heterogena tumörer.

(2) Vi forskar på ekvationer som anger hur viktiga tumöregenskaper förhåller sig till varandra: cellulär sammansättning av tumören, heterogenitet av cancer och immunceller som finns i tumören, rumslig organisation, tumörtillväxthastighet, utsöndringshastighet av metastaserande celler, och så vidare . Att hitta tumörbiologins lagar har stor potential för diagnostik, prognos och design av immunterapi, ungefär som mekanikens och aerodynamikens lagar för närvarande stödjer designen av bilar och flygplan.

För att göra det utför vi cancerexperiment in vitro och in vivo, vi utvecklar bioinformatik och dataanalys, och artikulerar våra resultat i matematisk teori.

Labbet är en del av avdelningen för cell- och molekylärbiologi (CMB) som ligger i Biomedicum, ett nytt tvärvetenskapligt forskningscentrum utformat för att samla mycket av den experimentella forskning som bedrivs vid Karolinska Institutet Campus Solna under ett tak för att främja samarbete. Biomedicum hyser cirka 1 200 forskare och annan personal och gör att dyr utrustning kan delas och utnyttjas mer effektivt.

https://www.hausserlab.org

Doktorandprojektet och doktorandens uppgifter

Du kommer att undersöka samspelet mellan tumörcellers transkriptionella heterogenitet, deras kondition och tumörernas rumsliga arkitektur. Specifikt, vilka genprogram stödjer cancercellernas kondition i de olika miljöer som finns i tumörer? Kan vi formulera kombinationsterapi som interfererar med gener över miljöer för att behandla heterogena tumörer?

För att ta reda på det kommer du att analysera encellig RNAseq och rumslig transkriptomikdata från patienter. Du kommer att odla 3D-tumörsfäroider, utföra encellig RNAseq, CRISPR-screening, flödescytometri och encellssortering. Du kommer att använda bioinformatikverktyg och multivariat statistik för att analysera data, samt utveckla nya tillvägagångssätt. Du kommer att artikulera mönstren som finns i en matematisk teori. Du kommer att använda insikten som vunnits för att designa behandlingar riktade mot heterogena tumörer, testa dessa in vitro och validera dem in vivo.

Vad erbjuder vi? 

Spännande vetenskap i ett labb idealiskt placerat för dig att lära dig hur du forskar i gränssnittet mellan experimentell och beräkningsbiologi, inom ett område av direkt medicinsk relevans.

En kreativ och inspirerande miljö fylld av kompetens och nyfikenhet. Karolinska Institutet är ett av världens ledande medicinska universitet. Vår vision är att driva utvecklingen av kunskap om livet och verka för en bättre hälsa för alla. Här bedriver vi framgångsrik medicinsk forskning och har det största utbudet av medicinska utbildningar i Sverige. Som doktorand erbjuds du ett individuellt forskningsprojekt, en välutbildad handledare, ett stort utbud av valbara kurser och möjligheten att arbeta i en framgångsrik forskargrupp. Karolinska Institutet har samarbeten med framstående universitet över hela världen, vilket ger möjlighet till internationella utbyten. Som anställd doktorand får du en avtalsenlig lön. Du får också träna fritt i våra moderna friskvårdsanläggningar och får ersättning för läkarvård.

Behörighetskrav för utbildning på forskarnivå

För att delta i urvalet till en doktorandplats måste du styrka både det grundläggande (A) och det särskilda (B) behörighetskravet innan ansökningsperioden stänger.

Det är ditt ansvar som sökande att styrka din behörighet genom att följa instruktionerna på webbsidan Behörighet till utbildning på forskarnivå.

A) Grundläggande behörighetskrav

Du uppfyller det grundläggande behörighetskravet för utbildning på forskarnivå om du:

1. har avlagt en examen på avancerad nivå (magister- eller masterexamen), eller
2. har fullgjort kursfordringar om minst 240 högskolepoäng, varav minst 60 högskolepoäng på avancerad nivå, eller
3. har på annat sätt förvärvat i huvudsak motsvarande kunskaper.*

Följ instruktionerna på webbsidan Behörighet till utbildning på forskarnivå.

*Om du anser dig ha motsvarande kunskaper ska du följa instruktionerna på webbsidan Bedömning av motsvarande kunskaper för grundläggande behörighet till utbildning på forskarnivå.

B) Särskilt behörighetskrav

Du uppfyller det särskilda behörighetskravet för utbildning på forskarnivå om du:

- Intygar kunskaper i engelska (motsvarande Engelska B/Engelska 6 vid gymnasiet med godkänt betyg).

Följ instruktionerna på webbsidan English language requirements for doctoral education.

Kontroll av dokument Karolinska Institutet gör kontroll av dokumenten för att upptäcka förfalskningar. Karolinska Institutet förbehåller sig rätten att återkalla antagningsbeslut om förfalskningar eller oriktigheter påvisas. Inlämnande av falska handlingar är ett brott mot svensk lag och anses vara grund för rättsliga åtgärder.

Färdigheter och personliga egenskaper

- Vi söker en student med en gedigen kvantativ utbildning som täcker multivariatkalkyl, linjär algebra, ordinarie och partiella differentialekvationer, dynamisk systemteori, sannolikhetsteori, på den nivå som en masterutbildning i beräkningsbiologi, fysik eller teknik ger.
- Kandidaten ska ha en god laganda och ett stort intresse för att upptäcka kvantitativa principer inom biologi och cancer.
- Kandidaten ska vara skicklig i R- och Python-programmering, känna till Linux-miljön.
- Erfarenhet av multivariat statistik och matematisk modellering kommer att värderas (inom biologi ett plus).
- Tidigare praktisk erfarenhet av encellig genuttrycksdata, cancer och evolution är ett stort plus.
– Kännedom om cellbiologi, cancerbiologi, immunologi och praktisk erfarenhet av att utföra experiment på celler är ett stort plus.

Studenten ska ha god kommunikationsförmåga i engelska (skriftligt och muntligt). 
Förmåga att arbeta i team kommer att värdesättas högt.

Villkor

Doktorandplatsen innebär en anställning som doktorand under maximalt 4 år på heltid.

--[Video om Karolinska Institutet, hur vi alla bidrar till en bättre hälsa för alla] ---

Ansökan

Du söker doktorandplatsen i rekryteringsverktyget Varbi. Använd knappen uppe till höger och följ anvisningarna. Vi ser gärna att din ansökan är skriven på engelska, men det går också bra att ansöka på svenska.

Din ansökan ska innehålla dessa dokument:

- En meritförteckning 
- Eventuella examensarbeten och publikationer 
- Andra dokument som styrker de ovan efterfrågade färdigheter och egenskaper 
- Dokument som styrker det grundläggande behörighetskravet (se A ovan)
- Dokument som styrker det särskilda behörighetskravet (se B ovan)
- Ett personligt brev (1-2 sidor) som innehåller svar på dessa frågor: vilken kurs eller projekt som du gillade mest under dina studier hittills, och varför? Om du kunde välja vilket ämne som helst, vad skulle du vilja jobba på i framtiden? Vilken är den mest intressanta forskningsfrågan du har arbetat med hittills, vilka metoder har du använt för att besvara dessa frågor och vad har du hittat?

Urval

Urval bland behöriga sökande görs med hänsyn till deras förmåga att tillgodogöra sig forskarutbildning. En samlad bedömning av de sökandes meriter och lämplighet kommer att göras.

Följande bedömningsgrunder tillämpas vid Karolinska Institutet:

- Dokumenterade ämneskunskaper av betydelse för forskningsområdet
- Analytisk skicklighet
- Övriga dokumenterade kunskaper/erfarenheter som kan ha betydelse för aktuell forskarutbildning  

Alla sökanden kommer att få information när rekryteringen är slutförd.

Vill du göra skillnad - och bidra till en bättre hälsa för alla? Sök till Karolinska Institutet