Doktorandplats inom i tumörsystembiologi - Under tillsättning eller tillsatt, ej sökbar

Att vara doktorand innebär att vara antagen till en utbildning på forskarnivå (forskarutbildning) där man följer en individuell studieplan. En doktorand ägnar sig åt ett forskningsprojekt under handledning, kompletterat med kurser och andra lärandeaktiviteter. För en doktorsexamen krävs motsvarande fyra års utbildning på forskarnivå på heltid.

Forskargruppen

Institutionen för cell- och molekylärbiologi (CMB) ligger i Biomedicum, ett nytt tvärvetenskapligt forskningscentrum som syftar till att samla mycket av den experimentella forskning som bedrivs vid Karolinska Institutet Campus Solna under ett tak för att främja samarbete. Biomedicum hyser cirka 1200 forskare och annan personal och gör att dyr utrustning kan delas och utnyttjas mer effektivt.

Hausserlabbet forskar om kvantitativa principer inom tumörbiologi. Inom en tumör uttrycker enstaka cancerceller olika gener. Dessa skillnader kan ge resistens mot anti-cancerterapi eftersom en given terapi kan misslyckas med att eliminera mångfalden av cancerceller. Vi är intresserade av att kartlägga de evolutionära gränserna för denna mångfald, och att utforska hur dessa gränser kan utnyttjas för att behandla heterogena tumörer. För att göra det kombinerar vi experiment in vitro och in vivo, bioinformatik och dataanalys och matematisk teori.

Doktorandprojektet och doktorandens uppgifter

Du kommer att undersöka samspelet mellan tumörcellers transkriptionella heterogenitet, deras kondition och tumörernas rumsliga arkitektur. Specifikt, vilka genprogram stödjer cancercellernas kondition i de olika miljöer som finns i tumörer?

För att ta reda på det kommer du att analysera encellig RNAseq och rumslig transkriptomikdata från patienter. Du kommer att odla tumörsfäroider, utföra encellig RNAseq, linjespårning, encellssortering och CRISPR-screening. Du kommer att använda bioinformatikverktyg och multivariat statistik för att analysera data, samt utveckla dina egna nya tillvägagångssätt. Du kommer att utveckla matematisk teori för att artikulera mönstren som hittas. Slutligen kommer du att använda insikten som vunnits för att designa behandlingar riktade mot heterogena tumörer, testa dessa in vitro och validera dem in vivo med hjälp av prekliniska modeller.

Vad erbjuder vi? 

En kreativ och inspirerande miljö fylld av kompetens och nyfikenhet. Karolinska Institutet är ett av världens ledande medicinska universitet. Vår vision är att driva utvecklingen av kunskap om livet och verka för en bättre hälsa för alla. Här bedriver vi framgångsrik medicinsk forskning och har det största utbudet av medicinska utbildningar i Sverige. Som doktorand erbjuds du ett individuellt forskningsprojekt, en välutbildad handledare, ett stort utbud av valbara kurser och möjligheten att arbeta i en framgångsrik forskargrupp. Karolinska Institutet har samarbeten med framstående universitet över hela världen, vilket ger möjlighet till internationella utbyten. Som anställd doktorand får du en avtalsenlig lön. Du får också träna fritt i våra moderna friskvårdsanläggningar och får ersättning för läkarvård.

Behörighetskrav för utbildning på forskarnivå

För att delta i urvalet till en doktorandplats måste du styrka både det grundläggande (A) och det särskilda (B) behörighetskravet innan ansökningsperioden stänger.

Det är ditt ansvar som sökande att styrka din behörighet genom att följa instruktionerna på webbsidan Behörighet till utbildning på forskarnivå.

A) Grundläggande behörighetskrav

Du uppfyller det grundläggande behörighetskravet för utbildning på forskarnivå om du:

1. har avlagt en examen på avancerad nivå (magister- eller masterexamen), eller
2. har fullgjort kursfordringar om minst 240 högskolepoäng, varav minst 60 högskolepoäng på avancerad nivå, eller
3. har på annat sätt förvärvat i huvudsak motsvarande kunskaper.*

Följ instruktionerna på webbsidan Behörighet till utbildning på forskarnivå.

*Om du anser dig ha motsvarande kunskaper ska du följa instruktionerna på webbsidan Bedömning av motsvarande kunskaper för grundläggande behörighet till utbildning på forskarnivå.

B) Särskilt behörighetskrav

Du uppfyller det särskilda behörighetskravet för utbildning på forskarnivå om du:

- Intygar kunskaper i engelska (motsvarande Engelska B/Engelska 6 vid gymnasiet med godkänt betyg).

Följ instruktionerna på webbsidan English language requirements for doctoral education.

Kontroll av dokument Karolinska Institutet gör kontroll av dokumenten för att upptäcka förfalskningar. Karolinska Institutet förbehåller sig rätten att återkalla antagningsbeslut om förfalskningar eller oriktigheter påvisas.

Färdigheter och personliga egenskaper

Vi söker en student med en gedigen kvantitativ utbildning som täcker multivariatkalkyl, linjär algebra, ordinära och partiella differentialekvationer, dynamisk systemteori, sannolikhetsteori, på den nivå som beviljas av en masterutbildning i beräkningsbiologi, fysik eller ingenjörskonst. Studenter utan beräkningsbiologisk utbildning ska ha skaffat sig motsvarande bakgrund i cellbiologi och utövat experiment på celler på annat sätt.

Kandidaten ska ha en god laganda, vara självgående och ett stort intresse för att upptäcka kvantitativa principer inom biologi och cancer.

Kandidaten bör vara skicklig i R- och Python-programmering, vara bekant med Linux-miljön och att utföra experiment på celler.

Erfarenhet av multivariat statistik, Bayesiansk statistik och matematisk modellering kommer att värderas (inom biologin ett plus).

Tidigare erfarenhet av encellsgenexpressionsdata, cancer och evolution är ett stort plus.
Studenten ska ha god kommunikationsförmåga på engelska (skriftligt och muntligt).

Förmåga att arbeta i team är viktigt och kandidatens personliga färdigheter kommer att värdesättas högt.

Villkor

Doktorandplatsen innebär en anställning som doktorand under maximalt 4 år på heltid.

Ansökan

Du söker doktorandplatsen i rekryteringsverktyget Varbi. Använd knappen uppe till höger och följ anvisningarna. Vi ser gärna att din ansökan är skriven på engelska, men det går också bra att ansöka på svenska.

Din ansökan ska innehålla dessa dokument:

- Ett personligt brev och curriculum vitae 
- Eventuella examensarbeten och publikationer 
- Andra dokument som styrker de ovan efterfrågade färdigheter och egenskaper 
- Dokument som styrker det grundläggande behörighetskravet (se A ovan)
- Dokument som styrker det särskilda behörighetskravet (se B ovan)

Urval

Urval bland behöriga sökande görs med hänsyn till deras förmåga att tillgodogöra sig forskarutbildning. En samlad bedömning av de sökandes meriter och lämplighet kommer att göras.

Följande bedömningsgrunder tillämpas vid Karolinska Institutet:

- Dokumenterade ämneskunskaper av betydelse för forskningsområdet
- Analytisk skicklighet
- Övriga dokumenterade kunskaper/erfarenheter som kan ha betydelse för aktuell forskarutbildning  

Alla sökanden kommer att få information när rekryteringen är slutförd.

Vill du göra skillnad - och bidra till en bättre hälsa för alla? Sök till Karolinska Institutet