Doktorandplats inom chromatin biologi - Under tillsättning eller tillsatt, ej sökbar

Vill du bidra till att förbättra människors hälsa?

Att vara doktorand innebär att vara antagen till en utbildning på forskarnivå (forskarutbildning) där man följer en individuell studieplan. En doktorand ägnar sig åt ett forskningsprojekt under handledning, kompletterat med kurser och andra lärandeaktiviteter. För en doktorsexamen krävs motsvarande fyra års utbildning på forskarnivå på heltid.

Forskargruppen

Laura Baranello labb: Utifrån vår expertis inom områdena topoisomeras och cancerbiologi, strävar vi efter att svara på grundläggande frågor om hur transkription, replikation och DNA-topologi är funktionellt koordinerade i mänskliga celler. Vi använder oss av de senaste metoderna för att bedöma transkriptomiska, epigenomiska och replisomiska profiler, såväl som av bioinformatik, mikroskopi och läkemedelstester för att förstå hur topoisomerasreglering påverkar grundläggande kärnprocesser (huvudreferenser: Baranello et al. Cell 2016; Wiegard et al. Molecular Cell 2021; Das et al. Molecular Cell 2022). Det övergripande målet är att avslöja nya cancerprocesser och utveckla nya anti-cancer strategier mer specifika mot tumörceller och med färre biverkningar.

Vi är ett ungt och dynamiskt forskarteam med ett väletablerat samarbetsnätverk. Gruppen är också knuten till Dr. Levens laboratorium vid National Institutes of Health i USA. Den utvalda sökanden kommer således att ingå i flera nätverk av erkända forskare. Gruppen är placerad i Biomedicum, en toppmodern forskningsbyggnad med en stor repertoar av forskare och tillgång till toppmodern infrastruktur och faciliteter.

Doktorandprojektet och doktorandens uppgifter

Topoisomeraser är viktiga enzymer som reglerar topologin hos DNA som gynnar replikation och transkription genom att klyva/återförsluta DNA-strängar. Eftersom cancerceller har högre frekvenser av proliferation jämfört med normala celler är de starkt beroende av topoisomerasaktivitet. Därför kan strategier för att rikta in sig på topoisomeraser utgöra ett sätt att selektivt påverka cancer celler.

Fokus för detta forskningsprojekt är att förstå hur topoisomeraser regleras under kärnprocesser för att utveckla nya sätt att rikta in sig på dessa regleringsmekanismer och påverka livscykeln för cancerceller. Nya bevis visar att topoisomeraser utför sin funktion genom interaktioner med partnerproteiner som modulerar deras aktivitet för att påverka transkription (Baranello et al. Cell 2016; Das et al. Molecular Cell 2022). Vi kommer att använda biokemiska och molekylärbiologiska tillvägagångssätt, mikroskopi, spårning av en molekyl, DNA- och RNA-sekvensering och CRISPR-baserad genomredigering för att undersöka hur topoisomerasdynamik inom kärnan styr topoisomerasaktivitet. Resultatet av doktorandarbetet kommer att inspirera till en ny strategi för att inrikta sig på topoisomeraser i cancerterapi.

Forskarutbildningen vid Karolinska Institutet motsvarar 4 års heltidsstudier. Projektet är en kombination av praktiska laborationer (våtlabbarbete) och beräkningsanalys (programmering i R och/eller Python). I programmet ingår även närvaro vid seminarier, kurser och konferenser. Doktoranden ska planera och genomföra experiment, analysera data, tolka och presentera resultaten samt skriva vetenskapliga artiklar, initialt under handledning men med större självständighet under projektets gång.

Vad erbjuder vi? 

En kreativ och inspirerande miljö fylld av kompetens och nyfikenhet. Karolinska Institutet är ett av världens ledande medicinska universitet. Vår vision är att driva utvecklingen av kunskap om livet och verka för en bättre hälsa för alla. Här bedriver vi framgångsrik medicinsk forskning och har det största utbudet av medicinska utbildningar i Sverige. Som doktorand erbjuds du ett individuellt forskningsprojekt, en välutbildad handledare, ett stort utbud av valbara kurser och möjligheten att arbeta i en framgångsrik forskargrupp. Karolinska Institutet har samarbeten med framstående universitet över hela världen, vilket ger möjlighet till internationella utbyten. Som anställd doktorand får du en avtalsenlig lön. Du får också träna fritt i våra moderna friskvårdsanläggningar och får ersättning för läkarvård.

Behörighetskrav för utbildning på forskarnivå

För att delta i urvalet till en doktorandplats måste du styrka både det grundläggande (A) och det särskilda (B) behörighetskravet innan ansökningsperioden stänger.

Det är ditt ansvar som sökande att styrka din behörighet genom att följa instruktionerna på webbsidan Behörighet till utbildning på forskarnivå.

A) Grundläggande behörighetskrav

Du uppfyller det grundläggande behörighetskravet för utbildning på forskarnivå om du:

1. har avlagt en examen på avancerad nivå (magister- eller masterexamen), eller
2. har fullgjort kursfordringar om minst 240 högskolepoäng, varav minst 60 högskolepoäng på avancerad nivå, eller
3. har på annat sätt förvärvat i huvudsak motsvarande kunskaper.*

Följ instruktionerna på webbsidan Behörighet till utbildning på forskarnivå.

*Om du anser dig ha motsvarande kunskaper ska du följa instruktionerna på webbsidan Bedömning av motsvarande kunskaper för grundläggande behörighet till utbildning på forskarnivå.

B) Särskilt behörighetskrav

Du uppfyller det särskilda behörighetskravet för utbildning på forskarnivå om du:

- Intygar kunskaper i engelska (motsvarande Engelska B/Engelska 6 vid gymnasiet med godkänt betyg).

Följ instruktionerna på webbsidan English language requirements for doctoral education.

Kontroll av dokument Karolinska Institutet gör kontroll av dokumenten för att upptäcka förfalskningar. Karolinska Institutet förbehåller sig rätten att återkalla antagningsbeslut om förfalskningar eller oriktigheter påvisas.

Färdigheter och personliga egenskaper

Vi söker en nyfiken, mycket motiverad och kreativ student med en bakgrund inom transkriptionsdynamik, kondensatreglering och DNA-topologi, med intresse för att lära sig programmeringsspråk för att analysera sekvenserings- och mikroskopidata. Kandidaten ska ha en god samarbetsförmåga och ett stort intresse för att lösa intrikata vetenskapliga frågor inom kromatinbiologi. Erfarenhet med däggdjurscellkulturer, proteinbiokemi, levande cell och konfokal avbildning, next-generation sekvensering och storskalig bioinformatikanalys är en styrka. Utmärkt samarbets- och kommunikationsförmåga (på engelska skriftligt och muntligt) krävs. Tonvikt kommer också att läggas på personlig lämplighet och att man passar väl in i den aktuella forskargruppen.

Villkor

Doktorandplatsen innebär en anställning som doktorand under maximalt 4 år på heltid.

Ansökan

Du söker doktorandplatsen i rekryteringsverktyget Varbi. Använd knappen uppe till höger och följ anvisningarna. Vi ser gärna att din ansökan är skriven på engelska, men det går också bra att ansöka på svenska.

Din ansökan ska innehålla dessa dokument:

- Ett personligt brev och curriculum vitae 
- Eventuella examensarbeten och publikationer 
- Andra dokument som styrker de ovan efterfrågade färdigheter och egenskaper 
- Dokument som styrker det grundläggande behörighetskravet (se A ovan)
- Dokument som styrker det särskilda behörighetskravet (se B ovan)

Urval

Urval bland behöriga sökande görs med hänsyn till deras förmåga att tillgodogöra sig forskarutbildning. En samlad bedömning av de sökandes meriter och lämplighet kommer att göras.

Följande bedömningsgrunder tillämpas vid Karolinska Institutet:

- Dokumenterade ämneskunskaper av betydelse för forskningsområdet
- Analytisk skicklighet
- Övriga dokumenterade kunskaper/erfarenheter som kan ha betydelse för aktuell forskarutbildning  

Alla sökanden kommer att få information när rekryteringen är slutförd.

Vill du göra skillnad - och bidra till en bättre hälsa för alla? Sök till Karolinska Institutet