Doktorandplats inom spatial transkriptomik, cancerimmunologi och antigendetektering

Vill du bidra till medicinsk forskning av toppkvalitet?

Att vara doktorand innebär att vara antagen till en utbildning på forskarnivå (forskarutbildning) där man följer en individuell studieplan. En doktorand ägnar sig åt ett forskningsprojekt under handledning, kompletterat med kurser och andra lärandeaktiviteter. För en doktorsexamen krävs motsvarande fyra års utbildning på forskarnivå på heltid.

Forskargruppen

En doktorandtjänst är tillgänglig inom Engblom labbet inom immunologi, cancer och spatial transkriptomik, med det övergripande målet att förstå tumörassocierade immunsvar och utnyttja dessa för terapi. Målet för labbets forskning är att förstå B-cellsrelaterade mekanismer i cancer för att identifiera nya sätt att behandla tumörer och andra inflammatoriska sjukdomar. För att göra detta undersöker vi de spatiella relationerna mellan B-cellkloner och deras omkringliggande nischer inom cancervävnader med hjälp av vår egenutvecklade teknologi (Spatial VDJ). Med hjälp av etablerade och nyutvecklade algoritmer kartlägger vi B-cellsutveckling inom tumörer och identifierar potentiella tumörreglerande antikroppar för funktionella tester. Utöver labbets fokusområde har vår forskargrupp nationella och internationella samarbetsprojekt inom interaktioner mellan människa och mikrober, vaccinforskning, slemhinneimmunologi och teknologisk utveckling.  

Doktorandprojektet och doktorandens uppgifter

Doktoranden kommer att delta i ett forskningsprogram som fokuserar på att förstå rollen av B- och plasmaceller (B/PC) i cancer. Projektet syftar till att identifiera sjukdomsassocierade B-cellantigener och B/PC klonala dynamik med en kombination av teknologier inklusive spatial transkriptomik (hela transkriptomet och antigenreceptorer), flödescytometri, multiplex immunofluorescens, proteinarrayer och immunprecipitation-massespektrometri (IP-MS).

Kandidaten kommer att leda utvecklingen och tillämpningen av en antigendetekteringspipeline för bröstcancer och identifiera B/PC klonala dynamik i prekliniska modeller.

Den sökande förväntas lära sig att formulera forskningsfrågor och hypoteser, designa experiment, analysera data, delta i kurser, författa vetenskapliga manuskript, kommunicera vetenskap till sina kollegor och allmänheten, samt att tillämpa kritiskt tänkande inom den vetenskapliga miljön.

Den sökande kommer att ha ett nära samarbeta med andra studenter, doktorander, postdoktorer och forskare. Den sökande förväntas att designa och utföra experimentellt arbete med hjälp av djurmodeller och patientprover, och presentera resultat för allmän och specialiserad publik.

Vad erbjuder vi? 

En kreativ, internationell och inspirerande miljö fylld av kompetens och nyfikenhet. Karolinska Institutet är ett av världens ledande medicinska universitet. Här bedriver vi framgångsrik medicinsk forskning och har det största utbudet av medicinska utbildningar i Sverige. På KI får du träffa forskare med olika forskningsinriktningar som jobbar tillsammans. Det är det gränsöverskridande samarbetet som bidrar till KI:s världsledande position inom forskning. Som doktorand erbjuds du ett individuellt forskningsprojekt, en välutbildad handledare, ett stort utbud av valbara kurser och möjligheten att arbeta i en framgångsrik forskargrupp. Karolinska Institutet har samarbeten med framstående universitet över hela världen, vilket ger möjlighet till internationella utbyten. Som anställd doktorand får du en avtalsenlig lön, du får träna fritt i våra moderna friskvårdsanläggningar och du får ersättning för läkarvård.

Behörighetskrav för utbildning på forskarnivå

För att delta i urvalet till en doktorandplats måste du styrka både det grundläggande (A) och det särskilda (B) behörighetskravet innan ansökningsperioden stänger.

Det är ditt ansvar som sökande att styrka din behörighet genom att följa instruktionerna på webbsidan Behörighet till utbildning på forskarnivå.

A) Grundläggande behörighetskrav

Du uppfyller det grundläggande behörighetskravet för utbildning på forskarnivå om du:

1. har avlagt en examen på avancerad nivå (magister- eller masterexamen), eller
2. har fullgjort kursfordringar om minst 240 högskolepoäng, varav minst 60 högskolepoäng på avancerad nivå, eller
3. har på annat sätt förvärvat i huvudsak motsvarande kunskaper.*

Följ instruktionerna på webbsidan Behörighet till utbildning på forskarnivå.

*Om du anser dig ha motsvarande kunskaper ska du följa instruktionerna på webbsidan Bedömning av motsvarande kunskaper för grundläggande behörighet till utbildning på forskarnivå.

B) Särskilt behörighetskrav

Du uppfyller det särskilda behörighetskravet för utbildning på forskarnivå om du:

- Intygar kunskaper i engelska (motsvarande Engelska B/Engelska 6 vid gymnasiet med godkänt betyg).

Följ instruktionerna på webbsidan English language requirements for doctoral education.

Kontroll av dokument Karolinska Institutet gör kontroll av dokumenten för att upptäcka förfalskningar. Karolinska Institutet förbehåller sig rätten att återkalla antagningsbeslut om förfalskningar eller oriktigheter påvisas. Inlämnande av falska handlingar är ett brott mot svensk lag och anses vara grund för rättsliga åtgärder.

Färdigheter och personliga egenskaper

Vårt laboratorium har en ledig tjänst för en mycket kreativ och motiverad doktorand. Vi söker en kandidat med skicklighet och dokumenterad forskningserfarenhet, särskilt inom tumörimmunologi, spatial transkriptomik och B-cellbiologi.

Dessutom bör kandidaten ha dokumenterad erfarenhet av laboratorietekniker, såsom immunfärgning, mikroskopi, cellodling, flödescytometri och IP-MS, med särskilt fokus på antikroppprofilering. Vidare bör kandidaten ha dokumenterad erfarenhet och certifieringar för att arbeta med musmodeller.

Vi skulle också vilja se att kandidaten har erfarenhet av att genomföra reproducerbar forskning, särskilt för att etablera tumörexperiment i möss. Tidigare erfarenhet av spatial transkriptomik och Spatial VDJ, eller antigendesökningsmetoder (t.ex. proteinarrays) kommer att betraktas som en stark merit.

Kandidaten förväntas arbeta med mus- och patientprover. En avslutad masterexamen betraktas som en merit.

Tjänsten kommer att kräva självständigt arbete samt omfattande samarbete med andra experimentella grupper. Flytande färdigheter i både talad och skriven engelska är nödvändiga. Dokumenterad förmåga att analysera och presentera resultat både muntligt och skriftligt är viktigt.

Sökanden förväntas vara mycket engagerad, självständig, nyfiken och samarbetsvillig.

Villkor

Doktorandplatsen innebär en anställning som doktorand under maximalt 4 år på heltid.

Ansökan

Du söker doktorandplatsen i rekryteringsverktyget Varbi. Använd knappen uppe till höger och följ anvisningarna. Vi ser gärna att din ansökan är skriven på engelska, men det går också bra att ansöka på svenska.

Din ansökan ska innehålla dessa dokument:

- Ett personligt brev och curriculum vitae 
- Eventuella examensarbeten och publikationer 
- Andra dokument som styrker de ovan efterfrågade färdigheter och egenskaper 
- Dokument som styrker det grundläggande behörighetskravet (se A ovan)
- Dokument som styrker det särskilda behörighetskravet (se B ovan)

Urval

Urval bland behöriga sökande görs med hänsyn till deras förmåga att tillgodogöra sig forskarutbildning. En samlad bedömning av de sökandes meriter och lämplighet kommer att göras.

Följande bedömningsgrunder tillämpas vid Karolinska Institutet:

- Dokumenterade ämneskunskaper av betydelse för forskningsområdet
- Analytisk skicklighet
- Övriga dokumenterade kunskaper/erfarenheter som kan ha betydelse för aktuell forskarutbildning  

Alla sökanden kommer att få information när rekryteringen är slutförd.

Engblom labbet: https://www.scilifelab.se/researchers/camilla-engblom/

Vill du göra skillnad - och bidra till en bättre hälsa för alla? Sök till Karolinska Institutet